BioJava

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BioJava
Desenvolvedor Andreas Prlić
Lançamento Setembro 1999[1]
Versão estável 3.0.5
Escrito em Java
Sistema operacional Macintosh, Windows, Unix-like
Gênero(s) Bioinformática
Licença LGPL 2.1.
Página oficial biojava.org

O projeto BioJava é um projeto de código aberto dedicado a fornecer ferramentas Java para o processamento de dados biológicos[2] . Isto inclui objetos para a manipulação de seqüências, estruturas de proteínas, analisadores sintáticos de arquivo, CORBA interoperabilidade, DAS, acesso ao ACeDB, programação dinâmica, e rotinas de estatística.

A biblioteca BioJava é útil para automatizar muitos tarefas diárias e mundanas na área de bioinformática. A medida que a biblioteca amadurece, as bibliotecas BioJava tem fornecido uma base sobre a qual tanto o software livre quanto pacotes comerciais podem ser desenvolvidos. O projeto fornece kits de ferramentas com múltiplas funções que tornam mais fácil a criação de análises ou pipelines customizados[1] .

É um projeto de software ativo de código aberto apoiado pela Open Bioinformatics Foundation.

Ver também[editar | editar código-fonte]

Referências

  1. a b Mangalam, Harry. (Setembro 2002). "The Bio* toolkits--a brief overview". Brief Bioinform 3 (3) p. 296-302. DOI:10.1093/bib/3.3.296. ISSN 1467-5463. PMID 12230038.
  2. Holland1, R. C. G.; Down2, T. A.; Pocock, M.; Prlić4, A.; Huen, D.; James, K.; Foisy, S.; Dräger, A.; Yates, A.; Heuer, M.; Schreiber, M. J.. (2008). "BioJava: an open-source framework for bioinformatics". Bioinformatics 24 (18) p. 2096-2097. DOI:10.1093/bioinformatics/btn397.

Ligações externas[editar | editar código-fonte]