MAFFT
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| MAFFT | |
|---|---|
| Desenvolvedor | Kazutaka Katoh |
| Versão estável | 6.850 (6 de março de 2011) |
| Escrito em | C |
| Sistema Operacional | UNIX, Linux, Mac, MS-Windows |
| Gênero(s) | Bioinformática |
| Licença | Livre para usuários acadêmicos |
| Página oficial | website |
| Portal das Tecnologias de informação | |
MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos.1 2 . MAFFT foi desenvolvida com maior velocidade para obter alinhamento múltiplo de sequências e, para tal, transformadas rápidas de Fourier foram usadas no procedimento3 . MAFFT está disponível gratuitamente para uso acadêmico, sem qualquer garantia.4 .
Ver também [editar]
- Clustal
- PHYLIP
- MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis
- PAUP
- T-Coffee
- MUSCLE
- Bioinformática
- Filogenética computacional
- Alinhamento múltiplo de sequências
Ligações externas [editar]
- Sítio oficial
- Servidos online MAFFT
- Servidor MAFFT na EBI
- ClustalW / MAFFT / PRRN na GenomeNet
- ClustalW / TCoffee / MAFFT no MyHits, SIB
Referências
- ↑ Katoh, Kazutaka; Misawa, Kazuharu; Kuma, Kei-ichi; Miyata, Takashi. (2002). "MAFFT: a novel method for rapid multiple sequence alignment based on fast Fourier transform". Nucleic Acids Research 30 (14) pp. 3059–66. DOI:10.1093/nar/gkf436. PMID 12136088.
- ↑ Katoh, Kazutaka; Kuma, Kei-ichi; Toh, Hiroyuki; Miyata, Takashi. (2005). "MAFFT version 5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment". Nucleic Acids Research 33 (2) pp. 511–8. DOI:10.1093/nar/gki198. PMID 15661851.
- ↑ Sharma, Kal Rengannathan. Bioinformatics: Sequence Alignment and Markov Models (em inglês). New York: McGraw Hill, 2009. p. 122. ISBN 978-0-07-159306-9
- ↑ licença MAFFT