Open Bioinformatics Foundation

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A Open Bioinformatics Foundation é uma organização sem fins lucrativos, voluntária focada em apoiar programação em código aberto na área de bioinformática.

A missão da fundação é apoiar o desenvolvimento de kits de ferramentas de código aberto para bioinformática, organizar e executar a Bioinformatics Open Source Conference, e, geralmente, ajudar no desenvolvimento e promoção do desenvolvimento de software de código aberto nas ciências da vida.

A fundação hospeda servidores para listas de discussão, websites, e repositórios de código para os seguintes projetos de código aberto:

  • BioDAS (ver: [1]) - Infra-estrutura para a troca de anotações do genoma em XML
  • BioJava - Java toolkit
  • BioMOBY - Dados e execução de aplicações através de web services
  • BioPerl - Perl toolkit
  • BioPipe - Pipelines e projetos de workflow para criação de protocolos de bioinformática
  • BioPython - Python toolkit
  • BioRuby - Ruby toolkit
  • BioPHP
  • BioSQL - RDBMS Esquema de banco de dados para armazenamento de seqüências , anotações, e dados de taxa.
  • OBDA (ver: [2]) - um padrão para acesso a dados de seqüências locais, remotamente, via RDBMS
  • EMBOSS - toolkit para análise de seqüências.

Ver também[editar | editar código-fonte]

Ligações externas[editar | editar código-fonte]