O Estadual foi disputado em duas fases. Na 1ª todos jogaram contra todos em turno único, sendo o campeão o clube que somasse mais pontos. Na segunda fase as equipes se dividiram em duas chaves de quatro, de acordo com a posição dos clubes na Taça Estado do Amazonas(O grupo 1 era formado pelo 1º,4º,5º e 8º colocados respectivamente. O grupo 2 era formado pelo 2º,3º,6º e 7º colocados respectivamente). O campeão saiu do cruzamento olímpico (1º do grupo 1 contra o 2º do grupo 2; e 1º do 2 contra o 2º do 1). Se um mesmo clube vencesse os dois turnos seria declarado o campeão de 2007.
Em caso de campeões diferentes haveria a final em duas partidas.
O campeão e o vice ganhariam o direito de disputar a Série C 2007 e a Copa do Brasil de 2008.
Caso os jogos terminassem em empate, os classificados para a final seriam decididos através das campanhas dos semifinalistas no segundo turno;quem tivesse a melhor campanha na primeira fase, sairia classificado para a final do turno.
*Partida suspensa aos 16 minutos do segundo tempo após a marcação de um pênalti a favor do Princesa, contestado pelos jogadores do Rio Negro. A decisão do TJD declarou o Princesa
vencedor por 1x0 e eliminou o Rio Negro do campeonato.
A final foi disputada em dois jogos no Vivaldão, entre Fast Clube, campeão do 1º turno, contra Nacional, campeão do 2º turno, nos dias 24 e 27 de maio de 2007.Em caso de empate nas duas partidas, o Nacional se sagraria campeão amazonense de 2007, por ter melhor campanha geral no campeonato.
