Proteína de ligação ao ADN de fita simples
Proteína de ligação ao ADN de fita simples (abreviada na literatura científica em inglês como SSB, single-strand DNA-binding protein) é uma proteína encontrada em bactérias Escherichia coli (E. coli), that se liga a regiões de fita simples de ácido desoxirribonucleico (ADN).[1] O DNA de fita simples é produzido durante todos os aspectos do metabolismo do DNA: replicação, recombinação e reparo. Além de estabilizar esse DNA de fita simples, as proteínas SSB se ligam e modulam a função de inúmeras proteínas envolvidas em todos esses processos.
SSB de E. coli ativa é composto por quatro subunidades idênticas de 19 kDa. A ligação do DNA de fita simples ao tetrâmero pode ocorrer em diferentes "modos", com SSB ocupando diferentes números de bases de DNA, dependendo de vários fatores, incluindo a concentração de sal. Por exemplo, o modo de ligação (SSB)65, no qual aproximadamente 65 nucleotídeos de DNA envolvem o tetrâmero SSB e entram em contato com todas as suas quatro subunidades, é favorecido em altas concentrações de sal in vitro. Em concentrações mais baixas de sal, o modo de ligação (SSB)35, em que cerca de 35 nucleotídeos se ligam a apenas duas das subunidades SSB, tende a se formar. Trabalho posterior ainda é necessário para elucidar as funções dos vários modos de ligação in vivo.
SSB bacteriano[editar | editar código-fonte]
| SSB | |
|---|---|
 | |
| Indicadores | |
| Símbolo | SSB |
| Pfam | PF00436 |
| InterPro | IPR000424 |
| PROSITE | PDOC00602 |
| SCOP | 1kaw |
| TCDB | 3.A.7 |
Domínios de proteína SSB em bactéria são importantes em sua função de manutenção do metabolismo do ANA, mais especificamente replicação do ADN, reparo e recombinação.[2] Tem uma estrutura de três fitas beta para uma única folha-beta de seis fitas para formar um dímero de proteína.[3]
Ver também[editar | editar código-fonte]
Referências
- ↑ Oakley, A.J. (2014). «Intramolecular binding mode of the C-terminus of Escherichia coli single-stranded DNA binding protein determined by nuclear magnetic resonance spectroscopy.». Nucleic Acids Research. 42 (4): 2750–7. PMC 3936761
. PMID 24288378. doi:10.1093/nar/gkt1238
- ↑ Meyer, RR; Laine, PS (Dezembro de 1990). «The single-stranded DNA-binding protein of Escherichia coli». Microbiol. Rev. 54 (4): 342–80. PMC 372786. PMID 2087220. doi:10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990
- ↑ Raghunathan, S; Ricard, CS; Lohman, TM; Waksman, G (Junho de 1997). «Crystal structure of the homo-tetrameric DNA binding domain of Escherichia coli single-stranded DNA-binding protein determined by multiwavelength x-ray diffraction on the selenomethionyl protein at 2.9-A resolution». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (13): 6652–7. PMC 21213. PMID 9192620. doi:10.1073/pnas.94.13.6652
Este artigo contém texto em domínio público de Pfam e InterPro IPR000635