Fundada em 2009, a agremiação esportiva Batalhão Futebol Clube originou-se da reativação do CNPJ 11.010.045/0001-63[5] de razão social Imagine Futebol Clube, a empresa desenvolve um trabalho social através da prática esportiva e tem como parceiro a Policia Militar do Tocantins, que detém o projeto social Escolinha de Futebol do 1° Batalhão de Polícia Militar, sediado em Palmas. No ano de 2023 o projeto social contava com mais de 600 alunos e tem como objetivo principal a inserção de crianças e adolescentes no esporte, afastando-os da vulnerabilidade e do uso de drogas.[6][5]
O projeto obteve destaque em 2023, quando além de conquistar títulos nas categorias de base da Federação Tocantinense de Futebol,[7] a equipe conseguiu no seu primeiro ano de profissionalização, realizar um bom campeonato profissional na segunda divisão,[8] terminando o ano com o título de campeão estadual da segunda divisão.[9][10]
Com o título,[4] a equipe garantiu vaga na primeira divisão tocantinense de 2024.[8][11][6]
Em 2024, o clube anunciou Maikon Leite para a disputa do Campeonato Tocantinense.[12]