Elemento ultra-conservado
Um elemento ultra-conservado (abreviado na literatura como UCE, do inglês ultra-conserved element) é uma região de DNA que é idêntico em pelo menos duas espécies diferentes.[1] Um dos primeiros estudos de UCEs mostraram que certos sequências de DNA humano de comprimento de 200 nucleotídeos ou maior foram inteiramente conservadas (sequência de ácido nucleico idêntica) em humanos, ratos e camundongos.[2] Apesar de ser frequentemente DNA não codificante,[3] alguns elementos ultra-conservados foram encontrados sendo transcricionalmente ativos, resultando em moléculas de RNA não codificante.[4]
Evolução[editar | editar código-fonte]
Conservação perfeita destes longos trechos de DNA é pensado como implicando em importância evolucionária como estas regiões parecem ter experimentado forte seleção negativa (purificação) por 300-400 milhões de anos.[2][3][5]
Referências
- ↑ Reneker J, Lyons E, Conant GC, Pires JC, Freeling M, Shyu CR, Korkin D (2012). «Long identical multispecies elements in plant and animal genomes». Proceedings of the National Academy of Sciences. 109 (19): E1183–E1191. ISSN 0027-8424. PMC 3358895
. PMID 22496592. doi:10.1073/pnas.1121356109
- ↑ a b Bejerano, G; Pheasant, M; Makunin, I; Stephen, S; Kent, WJ; Mattick, JS; Haussler, D (28 de maio de 2004). «Ultraconserved elements in the human genome.». Science. 304 (5675): 1321–5. PMID 15131266. doi:10.1126/science.1098119
- ↑ a b Katzman, S; Kern, AD; Bejerano, G; Fewell, G; Fulton, L; Wilson, RK; Salama, SR; Haussler, D (17 de agosto de 2007). «Human genome ultraconserved elements are ultraselected.». Science. 317 (5840). 915 páginas. PMID 17702936. doi:10.1126/science.1142430
- ↑ Calin GA, Liu CG, Ferracin M, Hyslop T, Spizzo R, Sevignani C, Fabbri M, Cimmino A, Lee EJ, Wojcik SE, Shimizu M, Tili E, Rossi S, Taccioli C, Pichiorri F, Liu X, Zupo S, Herlea V, Gramantieri L, Lanza G, Alder H, Rassenti L, Volinia S, Schmittgen TD, Kipps TJ, Negrini M, Croce CM (setembro de 2007). «Ultraconserved regions encoding ncRNAs are altered in human leukemias and carcinomas.». Cancer Cell. 12 (3): 215–29. PMID 17785203. doi:10.1016/j.ccr.2007.07.027
- ↑ Sathirapongsasuti JF, Sathira N, Suzuki Y, Huttenhower C, Sugano S (2011). «Ultraconserved cDNA segments in the human transcriptome exhibit resistance to folding and implicate function in translation and alternative splicing». Nucleic Acids Res. 39 (6): 1967–79. PMC 3064809. PMID 21062826. doi:10.1093/nar/gkq949
