Mostrar código-fonte de Proteína de ligação ao ADN de fita simples

'''Proteína de ligação ao ADN de fita simples''' (abreviada na [[literatura científica]] em [[Língua inglesa|inglês]] como '''SSB''', '''''s'''ingle-'''s'''trand DNA-'''b'''inding protein'') é uma [[proteína]] encontrada em [[bactéria]]s ''[[Escherichia coli]]'' (''E. coli''), that [[SSB|se liga a regiões de fita simples]] de ácido desoxirribonucleico ([[ADN]]).<ref>{{citar periódico
| ultimo1     = Oakley
| primeiro1  = A.J.
| ultimo2    = 
| primeiro2  = 
| data       = 2014
| titulo     = Intramolecular binding mode of the C-terminus of Escherichia coli single-stranded DNA binding protein determined by nuclear magnetic resonance spectroscopy.
| url        = https://www.uniprot.org/uniprot/P0AGE0
| periódico  = Nucleic Acids Research
| volume     = 42
| numero     = 4
| páginas    = 2750–7
| pmid = 24288378
| doi        = 10.1093/nar/gkt1238
| pmc = 3936761
| acessodata = 
}}</ref> O DNA de fita simples é produzido durante todos os aspectos do metabolismo do DNA: replicação, recombinação e reparo. Além de estabilizar esse DNA de fita simples, as proteínas SSB se ligam e modulam a função de inúmeras proteínas envolvidas em todos esses processos.

SSB de ''E. coli'' ativa é composto por quatro subunidades idênticas de 19 [[Unidade de massa atômica|kDa]]. A ligação do DNA de fita simples ao [[tetrâmero]] pode ocorrer em diferentes "modos", com SSB ocupando diferentes números de bases de DNA, dependendo de vários fatores, incluindo a concentração de sal.  Por exemplo, o modo de ligação (SSB)<sub>65</sub>, no qual aproximadamente 65 nucleotídeos de DNA envolvem o tetrâmero SSB e entram em contato com todas as suas quatro subunidades, é favorecido em altas concentrações de sal ''[[in vitro]]''. Em concentrações mais baixas de sal, o modo de ligação (SSB)<sub>35</sub>, em que cerca de 35 nucleotídeos se ligam a apenas duas das subunidades SSB, tende a se formar. Trabalho posterior ainda é necessário para elucidar as funções dos vários modos de ligação ''[[in vivo]]''.

== SSB bacteriano ==

{{Info/Família de proteínas
| simbolo = SSB
| nome = SSB
| imagem = PDB 1v1q EBI.jpg
| imagem-tamanho = 
| legenda = Estrutura cristalina de PriB- uma proteína de replicação de DNA [[Primossomo|primossômico]] de ''Escherichia coli''
| Pfam = PF00436
| Pfam_clan = CL0021
| InterPro = IPR000424
| SMART = 
| PROSITE = PDOC00602
| MEROPS =
| SCOP = 1kaw
| TCDB = 3.A.7
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
}}

[[Domínio proteico|Domínios de proteína]] SSB em [[bactéria]] são importantes em sua função de manutenção do metabolismo do ANA, mais especificamente [[replicação do ADN]], reparo e recombinação.<ref name="pmid2087220">{{citar periódico |url= |titulo=The single-stranded DNA-binding protein of Escherichia coli |data=Dezembro de 1990 |acessodata= |periódico=Microbiol. Rev. |numero=4 |ultimo2=Laine |primeiro2=PS |páginas=342–80 |doi=10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990 |pmc=372786 |pmid=2087220 |volume=54 |ultimo1=Meyer |primeiro1=RR}}</ref>  Tem uma estrutura de três fitas beta para uma única [[folha-beta]] de seis fitas para formar um [[dímero de proteína]].<ref name="pmid9192620">{{citar periódico |url= |titulo=Crystal structure of the homo-tetrameric DNA binding domain of Escherichia coli single-stranded DNA-binding protein determined by multiwavelength x-ray diffraction on the selenomethionyl protein at 2.9-A resolution |data=Junho de 1997 |acessodata= |periódico=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |numero=13 |ultimo2=Ricard |primeiro2=CS |páginas=6652–7 |doi=10.1073/pnas.94.13.6652 |pmc=21213 |pmid=9192620 |ultimo3=Lohman |primeiro3=TM |ultimo4=Waksman |primeiro4=G |volume=94 |doi-access=free |ultimo1=Raghunathan |primeiro1=S}}</ref>

== Ver também ==

* [[Proteína de ligação ao AD]]

* [[SSB|Proteína de ligação de fita simples]]

* [[Comparação de software de simulação de ácido nucleico]]

{{referências}}

{{InterPro content|IPR000635}}

== Ligações externas ==

* {{MeshName|Single-Stranded+DNA+Binding+Proteins}}
* [https://web.archive.org/web/20120710125521/http://pfam.sanger.ac.uk/family/PF00436 SSB no PFAM]

[[Categoria:Famílias de proteínas]]
[[Categoria:Replicação de DNA]]
[[Categoria:Proteínas]]
[[Categoria:DNA]]