Sequencia Chi (Crossover hotspot instigator)

Origem: Wikipédia, a enciclopédia livre.

A sequência Chi cujo nome vem da abreviação do inglêscrossover hotspot instigator” é um pequeno trecho de DNA no genoma de uma bactéria onde a recombinação homóloga é mais provável de ocorrer do que no restante de todo o genoma. A sequência Chi é única para cada grupo de organismos intimamente relacionados; em E. coli e outras bactérias entéricas, a sequência central é 5'-GCTGGTGG-3'. A sequencia Chi aparece diversas vezes no cromossomo e está presente com muito mais frequência do que o previsto estatisticamente para uma sequência aleatória. Porém suas sequência e representação estatística no genoma podem diferir de acordo com as características particulares do hospedeiro como por exemplo, as sequências Chi são mais frequentes em E. coli e outras bactérias mesófilas do que em bactérias termofílicas.

A sequencia Chi está envolvida principalmente na recombinação ou mesmo de reparo do DNA. Ambos os processos tem inicio semelhantes pela ação da RecBCD, a enzima RecBCD é um complexo proteico de grande importância, ele é formado por três subunidades (RecB, RecC e RecD). A subunidade responsável por identificar a sequência Chi é a RecC que ao identifica-la a partir da sua extremidade 3', desencadeia uma serie de mudanças na atividade da enzima, pois à medida que desenrola o DNA, RecBCD corta uma das fitas do DNA próximo a Chi, então o DNA de fita simples 3' resultante (ssDNA) é ligado por múltiplas moléculas de proteína RecA que facilitam a "invasão de fita", na qual uma fita de um DNA de fita dupla homóloga é deslocada pelo ssDNA associado a RecA. Este processo pode ocorrer tanto no crossinover quanto no reparo do DNA, quando ocorre a quebra de uma das fitas.

Referências

[1]

"Fonte:<Smith GR. (2012). How RecBCD Enzyme and Chi Promote DNA Break Repair and Recombination: a Molecular Biologist's View. Microbiol Mol Biol Rev. 76(2): 217-28. PMID 22688812>"

"Fonte: <Dillingham MS, Kowalczykowski SC. (2008). RecBCD enzyme and the repair of double-stranded DNA breaks. Microbiol Mol Biol Rev. 72(4): 642-671. PMID 19052323>"

"Fonte: <Lao PJ, Forsdyke DR. Crossover hot-spot instigator (Chi) sequences in Escherichia coli occupy distinct recombination/transcription islands. Gene. 2000 Feb 8;243(1-2):47-57. doi: 10.1016/s0378-1119(99)00564-8. PMID: 10675612.>"

"Fonte: <Sourice S, Biaudet V, El Karoui M, Ehrlich SD, Gruss A. Identification of the Chi site of Haemophilus influenzae as several sequences related to the Escherichia coli Chi site. Mol Microbiol. 1998 Mar;27(5):1021-9. doi: 10.1046/j.1365-2958.1998.00749.x. PMID: 9535091.>"

"Fonte: <Amundsen SK, Sharp JW, Smith GR. RecBCD Enzyme "Chi Recognition" Mutants Recognize Chi Recombination Hotspots in the Right DNA Context. Genetics. 2016 Sep;204(1):139-52. doi: 10.1534/genetics.116.191056. Epub 2016 Jul 8. PMID: 27401752; PMCID: PMC5012381.>"

  1. Smith GR. (2012). How RecBCD Enzyme and Chi Promote DNA Break Repair and Recombination: a Molecular Biologist's View. Microbiol Mol Biol Rev. 76(2): 217-28. PMID 22688812