Ontologia celular

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A Ontologia Celular é uma ontologia que visa capturar a diversidade de tipos de células em animais.[1] Faz parte da Open Biomedical and Biological Ontologies (OBO) Foundry.[2] Os identificadores e a estrutura organizacional da Ontologia Celular são usados para anotar dados no nível dos tipos de células, por exemplo, em estudos de RNA-seq unicelulares.[3] É um recurso importante na construção do Atlas da Célula Humana.[4]

A Ontologia Celular foi descrita pela primeira vez em um artigo acadêmico em 2005.[5]

Ver também[editar | editar código-fonte]

Notas[editar | editar código-fonte]

  • Este artigo foi inicialmente traduzido, total ou parcialmente, do artigo da Wikipédia em inglês cujo título é «Cell ontology».

Referências

  1. Diehl AD, Meehan TF, Bradford YM, Brush MH, Dahdul WM, Dougall DS, et al. (julho de 2016). «The Cell Ontology 2016: enhanced content, modularization, and ontology interoperability». Journal of Biomedical Semantics. 7 (1). 44 páginas. PMC 4932724Acessível livremente. PMID 27377652. doi:10.1186/s13326-016-0088-7 
  2. Smith B, Ashburner M, Rosse C, Bard J, Bug W, Ceusters W, et al. (novembro de 2007). «The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration». Nature Biotechnology. 25 (11): 1251–5. PMC 2814061Acessível livremente. PMID 17989687. doi:10.1038/nbt1346 
  3. Bernstein MN, Ma Z, Gleicher M, Dewey CN (janeiro de 2021). «CellO: comprehensive and hierarchical cell type classification of human cells with the Cell Ontology». iScience. 24 (1). 101913 páginas. Bibcode:2021iSci...24j1913B. PMC 7753962Acessível livremente. PMID 33364592. doi:10.1016/j.isci.2020.101913 
  4. Osumi-Sutherland, David; Xu, Chuan; Keays, Maria C.; Kharchenko, Peter V.; Regev, Aviv; Lein, Ed S.; Teichmann, Sarah (28 de junho de 2021). «Cell type ontologies of the Human Cell Atlas». Nature Cell Biology (em English). 23 (11): 1129–1135. arXiv:2106.14443Acessível livremente. doi:10.1038/s41556-021-00787-7 
  5. Bard, Jonathan; Rhee, Seung Y.; Ashburner, Michael (2005). «An ontology for cell types». Genome Biology (em inglês). 6 (2): R21. PMC 551541Acessível livremente. PMID 15693950. doi:10.1186/gb-2005-6-2-r21 

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