IBDmix
O IBDmix é um método probabilístico para identificar sequências de homininas introgressadas, que não utilizam uma população de referência moderna. O método IBDmix é baseado na identidade por linhagem.[1]
O IBDmix calcula as probabilidades de que um local variante em um indivíduo moderno seja e não seja compartilhado com um genoma arcaico de referência, enquanto contabiliza erros de genotipagem nas sequências humanas arcaicas e modernas de referência. O método usa um algoritmo de programação dinâmica para somar pontuações LOD de site único e maximizar essa pontuação para identificar segmentos introgressados.[2] Entretanto, IBDmix não pode ser usado em genomas individuais ou em amostras pequenas.
Cálculo de genes neandertais para migração humana da África[editar | editar código-fonte]
Joshua Akey, geneticista da Universidade de Princeton, aproveitando o fato de que parentes compartilham extensões do DNA correspondente, descobriu que os europeus tinham, em média, 51 milhões de pares de bases que correspondiam ao DNA neandertal e os asiáticos do leste, 55 milhões[3] e concluiu que um grupo de humanos modernos se expandiu para fora da África talvez 200.000 anos atrás e cruzou com os neandertais. Esses humanos modernos então desapareceram. O estudo foi calculado usando o método IBDmix.[4]
Referências
- ↑ «Modern Africans and Europeans may have more Neanderthal ancestry than previously thought». EurekAlert! (em inglês). Consultado em 3 de fevereiro de 2020
- ↑ «Everyone is a little Neanderthal, new study proves». Inverse (em inglês). Consultado em 3 de fevereiro de 2020
- ↑ Zimmer, Carl (19 de fevereiro de 2015). «A New Theory on How Neanderthal DNA Spread in Asia». The New York Times (em inglês). ISSN 0362-4331
- ↑ Zimmer, Carl (31 de janeiro de 2020). «Neanderthal Genes Hint at Much Earlier Human Migration From Africa». The New York Times (em inglês). ISSN 0362-4331
