Viés de uso de códon: diferenças entre revisões
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Revisão das 15h32min de 14 de novembro de 2018
Viés de uso de códon refere-se a diferenças na frequência de ocorrência de códons sinônimos na codificação de DNA. Um códon é uma série de três nucleotídeos (um tripleto) que codifica um aminoácido resíduo específico em uma cadeia de polipeptídeo ou para a terminação de translação (códons de parada).[1]
Existem 64 códons diferentes (61 códons codificando para aminoácidos mais 3 códons de parada) mas apenas 20 aminoácidos diferentes traduzidos. A superabundância no número de códons permite que muitos aminoácidos sejam codificados por mais de um códon. Por causa de tal redundância, é dito que o código genético é degenerado. Os códigos genéticos de diferentes organismos são frequentemente inclinados a usar um dos vários códons que codificam o mesmo aminoácido sobre os outros — isto é, uma maior frequência de um será encontrada do que o esperado por acaso. Como tais vieses surgem é uma área muito debatida de evolução molecular. Tabelas de uso de códons detalhando o viés de uso de códon genômico para a maioria dos organismos em GenBank e RefSeq pode ser encontrado no HIVE-Codon Usage Table database.[2]
Referências
- ↑ Behura SK, Severson DW.; Codon usage bias: causative factors, quantification methods and genome-wide patterns: with emphasis on insect genomes. Biol Rev Camb Philos Soc. 2013 Feb;88(1):49-61. doi: 10.1111/j.1469-185X.2012.00242.x. Epub 2012 Aug 14.
- ↑ Athey, John; Alexaki, Aikaterini; Osipova, Ekaterina; Rostovtsev, Alexandre; Santana-Quintero, Luis V.; Katneni, Upendra; Simonyan, Vahan; Kimchi-Sarfaty, Chava (2 de setembro de 2017). «A new and updated resource for codon usage tables». BMC Bioinformatics. 18 (391). PMC 5581930
. PMID 28865429. doi:10.1186/s12859-017-1793-7
