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Rhizobiaceae
Agrobacterium tumefaciens as it begins to infect a carrot cell
Classificação científica e
Domínio: Bacteria
Filo: Pseudomonadota
Classe: Alphaproteobacteria
Ordem: Hyphomicrobiales
Família: Rhizobiaceae
Conn 1938
Genera[3]
Rhizobiaceae
Agrobacterium tumefaciens começando a infectar a célula de uma cenoura
Scientific classification e
Domínio: Bacteria
Filo: Tenericutes
Classe: Alphaproteobacteria
Ordem: Rhizobiales
Família: Rhizobiaceae
Genera[3]

A Rhizobiaceae é uma família de proteobactérias que compreende vários subgrupos que potencializam e dificultam o desenvolvimento das plantas. [5] Algumas bactérias encontradas na família são utilizadas na nutrição das plantas e, coletivamente, constituem os rhizobium. Outras bactérias, como Agrobacterium tumefaciens e A. rhizogenes, alteram severamente o desenvolvimento das plantas em sua capacidade de induzir galhas em coroa ou raízes cabeludas encontradas no caule. A família é do interesse dos cientistas há séculos por sua capacidade de se associar às plantas e modificar o desenvolvimento das plantas. As Rhizobiaceae são, como todas as Proteobactérias, Gram-negativas . Eles são aeróbicos e as células geralmente têm a forma de bastonetes. [6] Muitas espécies de Rhizobiaceae são diazotróficas que são capazes de fixar nitrogênio e são simbióticas com as raízes das plantas.

Relação com Agrobacterium

As Agrobacterium foi reconhecida como relacionada ao Rhizobium . [7] As evidências que apoiam a associação foram conduzidas por inferências filogênicas baseadas em análises de sequência 16S rDNA mostrando que os gêneros não puderam ser distinguidos como clado monofilético separado.

A questão das Agrobacterium e outros gêneros incluídos por Rhizobium ainda não foi resolvida, já que alguns dados filogenéticos mais recentes sugerem que subclados ainda podem ser criados. [8] [1]

Filogenia

A taxonomia atualmente aceita é baseada no banco de dados online de 1997 "List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)" [3] e no Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia (NCBI), [9] e a filogenia é baseada em LTP 16S rRNA-base lançados 106 pelo "The All-Species Living Tree Project" (O Projeto Árvore Viva de Todas as Espécies)  

  1. a b c d e Mousavi SA, Willems A, Nesme X, de Lajudie P, Lindström K (2015). «Revised phylogeny of Rhizobiaceae: proposal of the delineation of Pararhizobium gen. nov., and 13 new species combinations». Syst Appl Microbiol. 38 (2): 84–90. PMID 25595870. doi:10.1016/j.syapm.2014.12.003  Erro de citação: Código <ref> inválido; o nome "Mousavi" é definido mais de uma vez com conteúdos diferentes
  2. Kimes NE, López-Pérez M, Flores-Félix JD, Ramírez-Bahena MH, Igual JM, Peix A, Rodriguez-Valera F, Velázquez E (2015). «Pseudorhizobium pelagicum gen. nov., sp. nov. isolated from a pelagic Mediterranean zone». Syst Appl Microbiol. 38 (5): 293–299. PMID 26078205. doi:10.1016/j.syapm.2015.05.003 
  3. a b c J.P. Euzéby. «Proteobacteria (scroll down for Rhizobiaceae)». LPSN. Consultado em 2 de maio de 2012. Cópia arquivada em 27 de janeiro de 2013  Erro de citação: Código <ref> inválido; o nome "LPSN" é definido mais de uma vez com conteúdos diferentes
  4. Kimes NE, López-Pérez M, Flores-Félix JD, Ramírez-Bahena MH, Igual JM, Peix A, Rodriguez-Valera F, Velázquez E (2015). "Pseudorhizobium pelagicum gen. nov., sp. nov. isolated from a pelagic Mediterranean zone". Syst Appl Microbiol. 38 (5): 293–299. doi:10.1016/j.syapm.2015.05.003. PMID 26078205.
  5. Spaink, Herman P.; Kondorosi, Adam; Hooykaas, Paul (6 de dezembro de 2012). The Rhizobiaceae: Molecular Biology of Model Plant-Associated Bacteria (em inglês). [S.l.]: Springer Science & Business Media. ISBN 9789401150606 
  6. Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (eds.) (2005). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume Two: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. New York, New York: Springer. ISBN 978-0-387-24145-6.
  7. Young, J. M.; Kuykendall, L. D.; Martínez-Romero, E.; Kerr, A.; Sawada, H. (1 de janeiro de 2003). «Classification and nomenclature of Agrobacterium and Rhizobium – a reply to Farrand et al. (2003)». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53: 1689–1695. PMID 13130069. doi:10.1099/ijs.0.02762-0Acessível livremente 
  8. Mousavi SA, Österman J, Wahlberg N, Nesme X, Lavire C, Vial L, Paulin L, de Lajudie P, Lindström K (2014). «Phylogeny of the RhizobiumAllorhizobiumAgrobacterium clade supports the delineation of Neorhizobium gen. nov.». Syst Appl Microbiol. 37: 208–15. PMID 24581678. doi:10.1016/j.syapm.2013.12.007 
  9. Sayers; et al. «Rhizobiaceae». NCBI taxonomy database. Consultado em 2 de maio de 2012