Predefinição:Excavata

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Euglenozoa	Euglenida (Euglena) · Kinetoplastida/Trypanosomatida (Trypanosoma, Leishmania)
Percolozoa/Heterolobosea	Schizopyrenida: Vahlkampfiidae (Naegleria) · Gruberellidae (Stachyamoeba) Acrasidae (Acrasis)

Jakobidae (Jakoba) · Histionidae (Reclinomonas, Histiona) · Andalucia

Trichozoa	Retortamonadida (Chilomastix, Retortamonas) · Diplomonadida (Giardia) · Carpediemonadida (Carpediemonas) · Parabasalidea/Trichomonadida (Trichomonas, Dientamoeba)
Anaeromonada	Trimastix · Oxymonadida (Dinenympha)

Outros

Malawimonas