MetaCyc: diferenças entre revisões

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Revisão das 20h28min de 16 de fevereiro de 2012

A base de dados MetaCyc contém vasta informação relativa às vias metabólicas e enzimas de imensos organismos. As vias metabólicas armazenadas são determinadas experimentalmente.^[1]^[2]^[3]

A MetaCyc oferece dados de referência para previsões computacionais das vias metabólicas dos organismos a partir dos seus genomas sequenciados, e tem sido usado na previsão de vias para milhares de organismos, nos quais se incluem aqueles na base de dados BioCyc.

A Metacyc contém ainda vasta informação relativa a enzimas individuais, descrevendo a sua estrutura subunitária, cofactores, activadores e inibidores, especificidade de substrato e, nalguns casos, as suas constantes cinéticas.

Referências

↑ Caspi R, Altman T, Dale JM; et al. (2010). «The MetaCyc database of metabolic pathways and enzymes and the BioCyc collection of pathway/genome databases.». Nucleic Acids Res. 38 (Database issue): D473-D479. PMC 2808959. PMID 19850718. doi:10.1093/nar/gkp875
↑ «MetaCyc Publications»
↑ Karp PD, Caspi R. (2011). «A survey of metabolic databases emphasizing the MetaCyc family.». Arch Toxicol. 85 (9): 1015–1033. PMID 21523460. doi:10.1007/s00204-011-0705-2

Ligações externas

MetaCyc

[pmid19850718-1] Caspi R, Altman T, Dale JM; et al. (2010). «The MetaCyc database of metabolic pathways and enzymes and the BioCyc collection of pathway/genome databases.». Nucleic Acids Res. 38 (Database issue): D473-D479. PMC 2808959. PMID 19850718. doi:10.1093/nar/gkp875

[metacyc.org-2] «MetaCyc Publications»

[pmid21523460-3] Karp PD, Caspi R. (2011). «A survey of metabolic databases emphasizing the MetaCyc family.». Arch Toxicol. 85 (9): 1015–1033. PMID 21523460. doi:10.1007/s00204-011-0705-2

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