Bamfordvirae: diferenças entre revisões

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Bamfordvirae
Classificação viral e
(unranked): Virus
Realm: Varidnaviria
Reino: Bamfordvirae
Subtaxa

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Bamfordvirae é um reino de vírus de DNA no domínio Varidnaviria que inclui os vírus gigantes (filo Nucleocytoviricota ) juntamente com o filo Preplasmaviricota que contém os virófagos, os adenovírus e várias famílias de vírus procarióticos, como os tectivírus, entre outros.[1][2]

Os vírus deste reino são caracterizados por codificar uma proteína espiral de gelatina dupla vertical (DJR-MCP) em comparação com o outro reino Helvetiavirae que codifica uma única proteína espiral de gelatina vertical (SJR-MCP). Os vírus Bamfordvirae parecem ter evoluído a partir de um evento em que duas proteínas SJR-MCP dos vírus Helvetiavirae se fundiram, dando origem à proteína do rolo gelatinoso vertical duplo (DJR-MCP), típica dessa linhagem. [3] Os vírus Bamfordvirae cruzaram eucariotos através de bacteriófagos relacionados a Tectiviridae, dando origem aos polintovírus que foram os primeiros vírus eucarióticos deste reino e que mais tarde dariam origem aos adenovírus, virófagos, vírus gigantes, plasmídeos mitocondriais (plasmídeos inativos encontrados nas mitocôndrias), plasmídeos de levedura (citoplasmático) e transpovirons (transposons de DNA encontrados nos genomas de vírus gigantes). Os polintovírus acabariam por ser endogenizados no genoma dos eucariotos tornando-se os polintons transposons . [4] [5] Vírus gigantes parecem ter evoluído de vírus pequenos por meio de duplicação e deleção de genes, inclusão de elementos genéticos móveis e aquisição massiva de genes de hospedeiros e bactérias, incluindo genes para tradução e genes de computador que são considerados os mais resistentes. transferência horizontal. [6] [7] [8] [9] [10] Os vírus gigantes podem ter dado origem aos vírus da classe Naldaviricetes ou descender de um ancestral compartilhado. [11] [12] [13]

Taxonomia

A taxonomia estabelecida pelo ICTV e por outras análises filogenéticas é a seguinte: [14]

Referências

  1. ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 de octubre de 2019). «Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins» (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (em inglês). Consultado em 10 de junio de 2020  Verifique data em: |acessodata=, |data= (ajuda)
  2. ↑ Kauffman KM, Hussain FA, Yang J, Arevalo P, Brown JM, Chang WK, VanInsberghe D, Elsherbini J, Sharma RS, Cutler MB, Kelly L, Polz MF (1 de febrero de 2018). «A Major Lineage of Non-Tailed dsDNA Viruses as Unrecognized Killers of Marine Bacteria». 554 (7690): 118-122. PMID 29364876. doi:10.1038/nature25474  Verifique data em: |data= (ajuda)
  3. ↑ Krupovic, M; Dolja, VV; Koonin, EV (14 de julio de 2020). «The LUCA and its complex virome.». PMID 32665595. doi:10.1038/s41579-020-0408-x. Consultado em 16 de agosto de 2020  Verifique data em: |data= (ajuda)
  4. ↑ Krupovic M, Bamford DH, Koonin EV (29 de abril de 2014). «Conservation of major and minor jelly-roll capsid proteins in Polinton (Maverick) transposons suggests that they are bona fide viruses». 9. 6 páginas. PMC 4028283Acessível livremente. PMID 24773695. doi:10.1186/1745-6150-9-6. Consultado em 10 de junio de 2020  Verifique data em: |acessodata= (ajuda)
  5. ↑ San Martin J, van Raaij MJ (23 de noviembre de 2018). «The So Far Farthest Reaches of the Double Jelly Roll Capsid Protein Fold». 15 (1). 181 páginas. PMC 6260650Acessível livremente. PMID 30470230. doi:10.1186/s12985-018-1097-1. Consultado em 10 de junio de 2020  Verifique data em: |acessodata=, |data= (ajuda)
  6. ↑ Natalya Yutin, Eugene Koonin (2019). Chapter Five - Evolution of the Large Nucleocytoplasmic DNA Viruses of Eukaryotes and Convergent Origins of Viral Gigantism. Science Direct.
  7. ↑ Natalya Yutin, Yuri I.Wolf, Eugene V.Koonin (2014). Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life. Science Direct. https://doi.org/10.1016/j.virol.2014.06.032
  8. ↑ Jonathan Filée (2013). Route of NCLDV evolution: the genomic accordion. Science Direct.
  9. ↑ David Moreira, Céline Brochier-Armanet (2008). Giant viruses, giant chimeras: The multiple evolutionary histories of Mimivirus genes. NCBI.
  10. ↑ Tom Williams, T Martin Embley, Eva Heinz (2011). Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses. Researchgate.
  11. ↑ a b Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic (2015). Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. Sciences Direct.
  12. ↑ a b Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic, Arvind Varsani, Yuri I. Wolf, Natalya Yutin, F. Murilo Zerbini, Jens H. Kuhn (2020). Global Organization and Proposed Megataxonomy of the Virus World. American Society for Microbiology.
  13. ↑ Johannes Jehlea, Yongjie Wang (2012). Phylogeny and Evolution of Hytrosaviridae. Science Direct.
  14. ↑ «Virus Taxonomy: 2020 Release» (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (em inglês). October 2018. Consultado em 13 octobre 2019  Verifique data em: |acessodata=, |data= (ajuda)
  15. ↑ Claire Bertelli, Linda Mueller, Vincent Thomas, Trestan Pillonel, Nicolas Jacquier, Gilbert Greub (2017). Cedratvirus lausannensis – digging into Pithoviridae diversity. Online Library.
  16. ↑ Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). The LUCA and its complex virome. Nature.
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