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O '''RaTG13''' é um [[Betacoronavírus|betacoronavirus]] semelhante ao virus da [[SARS]] que infecta o morcego ferradura, ''[[Rhinolophus affinis]]''. <ref>{{Citar periódico |titulo=Coexistence of multiple coronaviruses in several bat colonies in an abandoned mineshaft |data=February 2016 |paginas=31–40 |doi=10.1007/s12250-016-3713-9 |pmc=7090819 |pmid=26920708 |numero-autores=6 |volume=31 |journal=Virologica Sinica}}</ref> <ref>{{Citar periódico |url=https://www.nature.com/articles/s41586-020-2951-z |titulo=Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin |data=December 2020 |paginas=E6 |doi=10.1038/s41586-020-2951-z |pmid=33199918 |numero-autores=6 |volume=588 |doi-access=free |journal=Nature}}</ref> Ele foi descoberto em 2013 em excrementos de morcego em uma caverna de mineração perto da cidade de Tongguan, no condado de Mojiang, em [[Iunã|Yunnan]], [[China]] . É o parente mais próximo conhecido do [[Coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2|SARS-CoV-2]], o vírus que causa a [[COVID-19]]. <ref name="Poudel_2020">{{Citar periódico |titulo=Animal coronaviruses and coronavirus disease 2019: Lesson for One Health approach |data=October 2020 |paginas=239–251 |doi=10.4314/ovj.v10i3.1 |pmc=7703617 |pmid=33282694 |numero-autores=Poudel U, Subedi D, Pantha S, Dhakal S |volume=10 |doi-access=free |journal=Open Veterinary Journal}}</ref> <ref name="XiaoLi2020">{{Citar periódico |titulo=HIV-1 did not contribute to the 2019-nCoV genome |ano=2020 |paginas=378–381 |doi=10.1080/22221751.2020.1727299 |pmc=7033698 |pmid=32056509 |numero-autores=Xiao C, Li X, Liu S, Sang Y, Gao SJ, Gao F |volume=9 |doi-access=free |journal=Emerging Microbes & Infections}}</ref>
O '''RaTG13''' é um [[Betacoronavírus|betacoronavirus]] semelhante ao virus da [[SARS]] que infecta o morcego ferradura, ''[[Rhinolophus affinis]]''. <ref>{{Citar periódico |titulo=Coexistence of multiple coronaviruses in several bat colonies in an abandoned mineshaft |data=February 2016 |paginas=31–40 |doi=10.1007/s12250-016-3713-9 |pmc=7090819 |pmid=26920708 |numero-autores=6 |volume=31 |journal=Virologica Sinica}}</ref> <ref>{{Citar periódico |url=https://www.nature.com/articles/s41586-020-2951-z |titulo=Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin |data=December 2020 |paginas=E6 |doi=10.1038/s41586-020-2951-z |pmid=33199918 |numero-autores=6 |volume=588 |doi-access=free |journal=Nature}}</ref> Ele foi descoberto em 2013 em excrementos de morcego em uma caverna de mineração perto da cidade de Tongguan, no condado de Mojiang, em [[Iunã|Yunnan]], [[China]] . É o parente mais próximo conhecido do [[Coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2|SARS-CoV-2]], o vírus que causa a [[COVID-19]]. <ref name="Poudel_2020">{{Citar periódico |titulo=Animal coronaviruses and coronavirus disease 2019: Lesson for One Health approach |data=October 2020 |paginas=239–251 |doi=10.4314/ovj.v10i3.1 |pmc=7703617 |pmid=33282694 |numero-autores=Poudel U, Subedi D, Pantha S, Dhakal S |volume=10 |doi-access=free |journal=Open Veterinary Journal}}</ref> <ref name="XiaoLi2020">{{Citar periódico |titulo=HIV-1 did not contribute to the 2019-nCoV genome |ano=2020 |paginas=378–381 |doi=10.1080/22221751.2020.1727299 |pmc=7033698 |pmid=32056509 |numero-autores=Xiao C, Li X, Liu S, Sang Y, Gao SJ, Gao F |volume=9 |doi-access=free |journal=Emerging Microbes & Infections}}</ref>


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* Coronavírus semelhante ao SARS de morcego RsSHC014
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[[Categoria:Zoonoses]]
[[Categoria:Zoonoses]]

Revisão das 15h23min de 21 de março de 2021

O RaTG13 é um betacoronavirus semelhante ao virus da SARS que infecta o morcego ferradura, Rhinolophus affinis. [1] [2] Ele foi descoberto em 2013 em excrementos de morcego em uma caverna de mineração perto da cidade de Tongguan, no condado de Mojiang, em Yunnan, China . É o parente mais próximo conhecido do SARS-CoV-2, o vírus que causa a COVID-19. [3] [4]

Descoberta

Em 2012, três mineiros limpando fezes de morcego em uma mina de cobre abandonada perto da cidade de Tongguan, no condado autônomo de Mojiang Hani, desenvolveram pneumonia fatal. Amostras de soro coletadas dos mineiros foram enviadas ao Instituto de Virologia de Wuhan e testadas por Shi Zhengli e seu grupo para vírus Ebola, vírus Nipah e SARSr-CoV Rp3 de morcego. As amostras foram negativas. [5] [6] [7]

Para descobrir a possível causa da infecção, diferentes animais (incluindo morcegos, ratos e musaranhos ) foram amostrados dentro e ao redor da caverna de mineração. Entre 2012 e 2015, Shi Zhengli e seu grupo isolaram 293 diferentes coronavírus (284 alphacoronaviruses e 9 betacoronaviruses ) a partir de amostras de fezes de morcego na caverna. Uma das amostras coletadas em 2013, Rhinolophus affinis continha o RaTG13. O nome da cepa foi derivado da espécie de morcego original, localização geográfica e ano de coleta. [5] [6]

Em 2020, Shi e seu grupo retestaram as amostras de soro dos mineiros para SARS-CoV-2. As amostras foram negativas. [5]

Virologia

O RaTG13 é um vírus de RNA de fita positiva com membrana externa. Seu genoma é de aproximadamente 29.800 nucleotídeos. O genoma codifica uma replicase (ORF1a / 1b) e quatro proteínas estruturais; incluindo uma proteína spike (S), uma proteína de membrana (M), uma proteína de membrana externa (E) e uma proteína de nucleocapsídeo (N); e cinco proteínas não estruturais auxiliares, incluindo NS3, NS6, NS7a, NS7b e NS8, que são comuns em coronavírus . [8]

O RaTG13 tem forte semelhança com o vírus SARS-CoV-2 (compartilha 96,1% de similaridade de nucleotídeos) e sua existência é uma evidencia da origem natural do SARS-CoV-2. [9] A principal diferença entre RaTG13 e SARS-CoV-2 está no domínio de ligação ao receptor (RBD) da proteína spike (S), que é a porção que se liga ao receptor na superfície da célula hospedeira e causa infecção, indicando que o vírus RaTG13 pode não usar a enzima conversora de angiotensina 2 (ACE2) como receptor para entrar na célula. (o SARS-CoV-2 usa a ACE̊ como receptor). [10] Além disso, a proteína S do vírus RaTG13 não possui o motivo de clivagem de furina RRAR ↓ S.

Filogenia

Uma árvore filogenetica baseada nas amostras de coronavírus relacionados ao SARS-CoV2 é:[11][12]


SARS‑CoV‑2 related coronavirus
  zh, 81% to SARS-COV-2, Rhinolophus cornutus, Iwate, Japan[13]
 
 
 
 

SL-ZXC21, 88% to SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, Zhoushan, Zhejiang[14]

 
 

SL-ZC45, 88% to SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, Zhoushan, Zhejiang[14]

 
 
 
 

Pangolin SARSr-COV-GX, 89% to SARS-COV-2, Manis javanica, Smuggled from Southeast Asia[15]

 
 
 

Pangolin SARSr-COV-GD, 91% to SARS-COV-2, Manis javanica, Smuggled from Southeast Asia[16]

 
 
 
 

RshSTT182, 92.6% to SARS-COV-2, Rhinolophus shameli, Steung Treng, Cambodia[12]

 
 

RshSTT200, 92.6% to SARS-COV-2, Rhinolophus shameli, Steung Treng, Cambodia[12]

 
 
 
 

RacCS203, 91.5% to SARS-COV-2, Rhinolophus acuminatus, Chachoengsao, Thailand[11]

 
 

RmYN02, 93.3% to SARS-COV-2, Rhinolophus malayanus Mengla, Yunnan[17]

 
 
 
 

RaTG13, 96.1% to SARS-COV-2, Rhinolophus affinis, Mojiang, Yunnan

 
 

SARS-CoV-2

 
 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV-1, 79% to SARS-COV-2

 

Referências

  1. ↑ «Coexistence of multiple coronaviruses in several bat colonies in an abandoned mineshaft». Virologica Sinica. 31: 31–40. February 2016. PMC 7090819Acessível livremente. PMID 26920708. doi:10.1007/s12250-016-3713-9  Verifique data em: |data= (ajuda)
  2. ↑ «Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin». Nature. 588: E6. December 2020. PMID 33199918. doi:10.1038/s41586-020-2951-zAcessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda)
  3. ↑ «Animal coronaviruses and coronavirus disease 2019: Lesson for One Health approach». Open Veterinary Journal. 10: 239–251. October 2020. PMC 7703617Acessível livremente. PMID 33282694. doi:10.4314/ovj.v10i3.1Acessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda); Verifique o valor de |display-authors=Poudel U, Subedi D, Pantha S, Dhakal S (ajuda)
  4. ↑ «HIV-1 did not contribute to the 2019-nCoV genome». Emerging Microbes & Infections. 9: 378–381. 2020. PMC 7033698Acessível livremente. PMID 32056509. doi:10.1080/22221751.2020.1727299Acessível livremente  Verifique o valor de |display-authors=Xiao C, Li X, Liu S, Sang Y, Gao SJ, Gao F (ajuda)
  5. ↑ a b c «Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin». Nature. 588: E6. December 2020. PMID 33199918. doi:10.1038/s41586-020-2951-zAcessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda) Erro de citação: Código <ref> inválido; o nome ":0" é definido mais de uma vez com conteúdos diferentes
  6. ↑ a b «Coexistence of multiple coronaviruses in several bat colonies in an abandoned mineshaft». Virologica Sinica. 31: 31–40. February 2016. PMC 7090819Acessível livremente. PMID 26920708. doi:10.1007/s12250-016-3713-9  Verifique data em: |data= (ajuda) Erro de citação: Código <ref> inválido; o nome ":1" é definido mais de uma vez com conteúdos diferentes
  7. ↑ «Novel Henipa-like virus, Mojiang Paramyxovirus, in rats, China, 2012». Emerging Infectious Diseases (em inglês). 20: 1064–6. June 2014. PMC 4036791Acessível livremente. PMID 24865545. doi:10.3201/eid2006.131022Acessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda)
  8. ↑ «Bat coronavirus RaTG13, complete genome». NCBI. Consultado em 28 de março de 2020 
  9. ↑ «SARS‐CoV‐2, Covid‐19, and the debunking of conspiracy theories». Rev Med Virol (Review). February 2021. PMID 33586302. doi:10.1002/rmv.2222Acessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda); Verifique o valor de |display-authors=Hakim MS (ajuda)
  10. ↑ «The proximal origin of SARS-CoV-2». Nature Medicine. 26: 450–452. April 2020. PMC 7095063Acessível livremente. PMID 32284615. doi:10.1038/s41591-020-0820-9Acessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda); Verifique o valor de |display-authors=Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, Holmes EC, Garry RF (ajuda)
  11. ↑ a b Wacharapluesadee, S; Tan, CW; Maneeorn, P; Duengkae, P; Zhu, F; Joyjinda, Y; Kaewpom, T; Chia, WN; Ampoot, W (9 February 2021). «Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia.». Nature Communications. 12. 972 páginas. PMC 7873279Acessível livremente. PMID 33563978. doi:10.1038/s41467-021-21240-1Acessível livremente  Verifique data em: |data= (ajuda)
  12. ↑ a b c Hul, Vibol; Delaune, Deborah; Karlsson, Erik A.; Hassanin, Alexandre; Tey, Putita Ou; Baidaliuk, Artem; Gámbaro, Fabiana; Tu, Vuong Tan; Keatts, Lucy (26 January 2021). «A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia». bioRxiv (em inglês). pp. 2021.01.26.428212. doi:10.1101/2021.01.26.428212  Verifique data em: |data= (ajuda)
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