Sequência de DNA

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Representação gráfica de um eletroferograma gerado por um sequenciador automático mostrando parte de uma sequência de DNA.

Uma sequência de DNA ou sequência genética é uma série de letras representando a estrutura primária de uma molécula ou cadeia de DNA, real ou hipotética, com a capacidade de carregar informação[1] .

As letras possíveis são A, C, G e T, representando os quatro nucleotídeos (subunidades) de uma cadeia de DNA – as bases adenina, citosina, guanina, timina, covalentemente ligadas a uma "coluna vertebral" de fósforo[1] . Tipicamente, as sequências são impressas uma ao lado da outra, sem espaços, como na sequência AAAGTCTGAC, de 5 a 3, indo da esquerda para a direita. Uma sucessão de quaisquer nucleotídeos maior que quatro está apta a ser considerada uma sequência. Com respeito à sua função biológica, a qual pode depender do contexto, uma sequência pode ou não "fazer sentido", e também ser codificável ou não-codificável. Sequências de DNA também pode conter "DNA lixo"[2] .

Sequências podem ser obtidas de material biológico através de um processo denominado sequenciamento de DNA[1] .

Em alguns casos especiais, outras letras além de A, T, C e G estão presentes numa sequência. Estas letras representam ambiguidade. De todas as moléculas experimentadas, há mais de um tipo de nucleotídeo naquela posição. Os códigos da International Union of Pure and Applied Chemistry (IUPAC) são assim discriminados[3] :

A = adenina
C = citosina
G = guanina
T = timina
U = uracil
R = G A (purina)
Y = T C (pirimidina)
K = G T (ceto)
M = A C (amino)
S = G C (ligações de hidrogênio fortes)
W = A T (ligações de hidrogênio fracas)
B = G T C (todos, menos A)
D = G A T (todos, menos C)
H = A C T (todos, menos G)
V = G C A (todos, menos T)
N = A G C T (qualquer nucleotídeo)

Referências

  1. a b c A Estrutura da molécula de DNA. Visitado em 20-05-2009.
  2. Julianna Kettlewell (maio 2004). 'Junk' throws up precious secret (em inglês) BBC News. Visitado em 20-05-2009.
  3. IUPAC code table (em inglês). Visitado em 20-05-2009.

Ver também[editar | editar código-fonte]

Ligações externas[editar | editar código-fonte]

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