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A ordem Morganucodonta inclui a família Morganucodontidae e em algumas classificações a família Megazostrodontidae.
- Ordem Morganucodonta Kermack, Mussett e Rigney, 1973
- Gênero Hallautheirum Clemens, 1980 (incertae sedis)
- Família Morganucodontidae Kühne, 1958
- Gênero Gondwanadon Datta e Das, 1996
- Gênero Indotherium Yadagari, 1984
- Gênero Morganucodon Kühne, 1949
- Gênero Helvetiodon Clemens, 1980
- Gênero Erythrotherium Crompton, 1964
- Gênero Brachyzostrodon [1] Sigogneau-Russell, 1983
- Gênero Eozostrodon Parrington, 1941
- ↑ Datta e Das (2001) sugeriram que este gênero faça parte da família Megazostrodontidae.
