TACK

TACK
	; Sulfolobus sp.
Classificação científica
Domínio:	Archaea;
Reino:	Proteoarchaeota;
Superfilo:	Grupo TACK; Guy & Ettema 2011
Filos
	"Aigarchaeota"; "Bathyarchaeota"; "Culexarchaeota"; "Gearchaeota"; "Geothermarchaeota"; "Korarchaeota"; "Marsarchaeota"; "Nezhaarchaeota"; Nitrososphaerota; Thermoproteota; "Verstraetearchaeota";
Sinónimos
	Crenarchaeota Garrity & Holt 2002; "Eocyta" Lake et al. 1984; "Filarchaeota" Cavalier-Smith 2014;

TACK é um clado de organismos pertencntes ao domínio Archaea, cujo nome é um acrónimo para Thaumarchaeota (agora Nitrososphaerota), Aigarchaeota, Crenarchaeota (agora Thermoproteota) e Korarchaeota, os primeiros grupos de arqueias descobertos pertencntes ao clado. Estes microrganismos ocorrem em ambientes que variam de acidofílicos termófilos a mesófilos e psicrófilos e com diferentes tipos de metabolismo, embora predominantemente organismos anaeróbicos e quimiossintéticos.^[3] TACK é um clado que é o grupo irmão do ramo Asgard que deu origem aos eucariontes. Foi proposto que o clado TACK seja classificado como Crenarchaeota e que o tradicional "Crenarchaeota" (Thermoproteota) seja classificado como uma classe chamada "Sulfolobia", em conjunto com os outros filos com nível taxonómico de classe.^[4]

Classificação[editar | editar código-fonte]

Thermoproteota (anteriormente Crenarchaeota) — grupo mais conhecida de Archaea e o mais abundante nos ecossistemas marinhos. Foram anteriormente considerados de sulfobactérias por causa de sua dependência em relação ao enxofre e são importantes como fixadores de carbono. Existem espécies hipertermófilas em fontes hidrotermais, mas alguns grupos são os organismos mais abundantes em profundidades inferiores a 100 m.
"Aigarchaeota" — filo proposto a partir do genoma da espécie candidata Caldiaarchaeum, subterrânea, encontrada nas profundezas de uma mina de ouro no Japão. Sequências genómicas deste grupo também foram encontradas em ambientes geotérmicos, terrestres e marinhos.
"Geoarchaeota" — organismos termofílicos que vivem em ambientes ácidos reduzindo o ferro férrico. Alternativamente, foi proposto que este e o grupo anterior realmente pertencem ao filo Nitrososphaerota.
Nitrososphaerota (anteriormente Thaumarchaeota) — inclui organismos mesófilos ou psicrófilos (médias e baixas temperaturas), de metabolismo quimiolitoautotrófico oxidante de amónia (nitrificantes) que podem desempenhar um papel importante em ciclos bioquímicos, como os ciclos do azoto e do carbono.
"Bathyarchaeota" — abundante nos sedimentos do fundo do mar com escassez de nutrientes. Pelo menos algumas linhagens apresentam homoacetogénese, um tipo de metabolismo até então considerado exclusivo das bactérias.
"Korarchaeota" — encontrados em ambientes hidrotermais e em baixa abundância, parecem diversificados em diferentes níveis filogenéticos de acordo com a temperatura, salinidade (água doce ou marinha) e geografia.

Filogenia[editar | editar código-fonte]

Os dados disponíveis permitrm construir os seguintes cladogramas:

McKay et al. 2019^[5]

com base em 16S rRNA LTP_06_2022^[6]^[7]^[8]

53 marcadores proteicos de GTDB 08-RS214^[9]^[10]^[11]

"TACK"

"Korarchaeota"

"Bathyarchaeota"

	"Aigarchaeota"

	Nitrososphaerota

"Verstraetearchaeota"

Thermoproteota

	"Geoarchaeota"

	"Marsarchaeota"

"TACK"

	Nitrososphaerales

	Nitrosopumilales

Thermoproteota

Thermoproteia

Thermoproteales

	Fervidicoccales

	Desulfurococcales 2

	Desulfurococcales

	Sulfolobales

"TACK"

"Korarchaeia"	"Korarchaeales"

"BAT"

"Bathyarchaeia" (MCG)

("Aigarchaeota")

	Conexivisphaerales

	Nitrososphaerales (Thaumarchaeota)

"Sulfobacteria"

"Methanomethylicia"

	"Methanomethylicales"

	"Nezhaarchaeales"

("Verstraetearchaeota")

"Thermoproteia"

"Gearchaeales"

	"Thermofilales"

	Thermoproteales

"Sulfolobia"

	"Marsarchaeales"

	Sulfolobales

Thermoproteota

Hipótese eócita[editar | editar código-fonte]

A hipótese do eócito proposta na década de 1980 por James Lake sugere que os eucariotas emergiram dentro dos eócitos procarióticos.^[12] Neste contexto, uma evidência que suporta uma estreita relação entre TACK e eucariotas é a presença de um homólogo da RNA polimerase subunidade Rbp-8 em Thermoproteota, mas não em Euryarchaea.^[13]

Ver também[editar | editar código-fonte]

Taxonomia do domínio Archaea

Referências[editar | editar código-fonte]

↑ Lake, J.A.; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, M.W.) (1984). «Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes». PNAS. 81 (12): 3786–3790. PMC 345305. PMID 6587394. doi:10.1073/pnas.81.12.3786
↑ Lake, J.A. (2015). «Eukaryotic origins». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 370 (1678). 20140321 páginas. PMC 4571561. PMID 26323753. doi:10.1098/rstb.2014.0321
↑ Guy, Lionel; Ettema, Thijs J.G. (2011). «The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes». Trends in Microbiology. 19 (12): 580–587. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002
↑ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). «Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)». Protoplasma. 257 (3): 621–753. PMC 7203096. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7
↑ McKay, L.J., Dlakić, M., Fields, M.W. et al. Co-occurring genomic capacity for anaerobic methane and dissimilatory sulfur metabolisms discovered in the Korarchaeota. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
↑ «The LTP». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
↑ «LTP_all tree in newick format». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
↑ «LTP_06_2022 Release Notes» (PDF). The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
↑ «GTDB release 08-RS214». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
↑ «ar53_r214.sp_label». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
↑ «Taxon History». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
↑ (UCLA) The origin of the nucleus and the tree of life Arquivado em 2003-02-07 na Archive.today
↑ Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). «Early evolution of eukaryotic DNA-dependent RNA polymerases». Trends Genet. 24 (5): 211–5. PMID 18384908. doi:10.1016/j.tig.2008.02.002
↑ Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. (2008). «The archaebacterial origin of eukaryotes». Proc Natl Acad Sci USA. 105 (51): 20356–61. Bibcode:2008PNAS..10520356C. PMC 2629343. PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105

[1] Lake, J.A.; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, M.W.) (1984). «Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes». PNAS. 81 (12): 3786–3790. PMC 345305. PMID 6587394. doi:10.1073/pnas.81.12.3786

[2] Lake, J.A. (2015). «Eukaryotic origins». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 370 (1678). 20140321 páginas. PMC 4571561. PMID 26323753. doi:10.1098/rstb.2014.0321

[Guy_Ettema_2011-3] Guy, Lionel; Ettema, Thijs J.G. (2011). «The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes». Trends in Microbiology. 19 (12): 580–587. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002

[4] Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). «Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)». Protoplasma. 257 (3): 621–753. PMC 7203096. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7

[5] McKay, L.J., Dlakić, M., Fields, M.W. et al. Co-occurring genomic capacity for anaerobic methane and dissimilatory sulfur metabolisms discovered in the Korarchaeota. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4

[6] «The LTP». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023

[7] «LTP_all tree in newick format». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023

[8] «LTP_06_2022 Release Notes» (PDF). The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023

[about-9] «GTDB release 08-RS214». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023

[tree-10] «ar53_r214.sp_label». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023

[taxon_history-11] «Taxon History». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023

[12] (UCLA) The origin of the nucleus and the tree of life Arquivado em 2003-02-07 na Archive.today

[13] Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). «Early evolution of eukaryotic DNA-dependent RNA polymerases». Trends Genet. 24 (5): 211–5. PMID 18384908. doi:10.1016/j.tig.2008.02.002

[14] Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. (2008). «The archaebacterial origin of eukaryotes». Proc Natl Acad Sci USA. 105 (51): 20356–61. Bibcode:2008PNAS..10520356C. PMC 2629343. PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]