Predefinição:Campeonato Brasileiro de Futebol de 2016 - Série D (fase final)
Em itálico, os times que possuem o mando de campo no primeiro jogo do confronto e em negrito os times classificados.
| Quartas de final | Semifinais | Final | ||||||||||||||||
| 27 de agosto a 4 de setembro | 11 a 18 de setembro | 25 de setembro e 1 de outubro | ||||||||||||||||
 Ituano
|
1 | 0 | 1 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 CSA 
|
2 | 1 | 3 | |||||||||||||||
| CSA
|
2 | 0 | 2 | |||||||||||||||
| São Bento
|
0 | 1 | 1 | |||||||||||||||
 Itabaiana
|
0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
| São Bento
|
1 | 2 | 3 | |||||||||||||||
| CSA
|
0 | 0 | 0 | |||||||||||||||
 Volta Redonda
|
0 | 4 | 4 | |||||||||||||||
 Moto Club
|
2 | 2 | 4 | |||||||||||||||
 Atlético Acreano
|
2 | 1 | 3 | |||||||||||||||
| Moto Club
|
1 | 1 | 2 | |||||||||||||||
| Volta Redonda
|
1 | 3 | 4 | |||||||||||||||
 Fluminense de Feira
|
2 | 1 | 3 | |||||||||||||||
| Volta Redonda
|
3 | 2 | 5 | |||||||||||||||
|
Equipes promovidas à Série C de 2017 |