Gene cutter

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Em biogenética, Gene Cutter ou Gene Cutter BRCA1 é uma ferramenta de extração de alinhamento de sequências e proteínas de HIV-1, HIV-2, SIV[1][2], semelhante ao sistema de CRISPR[3].

Aplicação[editar | editar código-fonte]

Os cientistas usaram uma enzima que corta o DNA, chamada Cas9[4], para cortar o vírus, a fim de forçar o mecanismo de reparação da célula a soldar as pontas soltas do genoma de volta - resultando em uma célula livre de vírus[5]. A ferramneta alinha as seqüências de nucleotídeos (se elas não estiverem alinhadas); grampeia codificando regiões a partir de um alinhamento de nucleotídeos; códon-alinha todas as regiões de codificação; e gera alinhamentos de nucleotídeo e proteínas das regiões de corte[6]. O processo poderia ser uma cura não só a SIDA, mas também para outras infecções latentes[7].

Referências

  1. Characterization of full-length HIV-1 CRF17_BF genomes and comparison to the prototype CRF12_BF strains por Paula C. Aulicino, et al, publicado "Infect Genet Evol." em 2012; 12(2): 443–447. - doi: 10.1016/j.meegid.2012.01.003
  2. Seven full-length HIV-1 nucleotide sequences from Argentina (AR.1999.ARMA038 AY037281, AR.2002.AR02-ARG1139 EU58 1825, AR.2002.AR02-ARG2233 EU581826); Bolivia (BO.2002. BO02-BOL119 EU581827); Paraguay (PY.2002.PY02-PSP0096 EU581823, PY.2002.PY02-PSP0073 EU581824); and Peru (PE.2002.PE02-PCR0155 [EU581828]) denoted as CRF17_BF were retrieved from the Los Alamos HIV Sequence Database and aligned with CRF12_BF, B, C, D and F1 subtype reference sequences using the GeneCutter Tool.
  3. Gene Cutter publicado por "Los Alamos National Security" (2016)
  4. HIV-1 Vpr induces ATM-dependent cellular signal with enhanced homologous recombination por C Nakai-Murakami, et al, publicado em "Oncogene" artigo 26, 477–486. doi:10.1038/sj.onc.120983 (2007)
  5. Scientists 'delete' HIV virus from human DNA for the first time por ELLIE ZOLFAGHARIFARD, publicado no "DailyMail" (2016)
  6. Gene Cutter Sequence Alignment and Protein Extraction publicado pelo "U.S. Department of Energy's National Nuclear Security Administration " (2016)
  7. DNA damage repair machinery and HIV escape from innate immune sensing por Christelle Brégnard et al, publicado por Front. Microbiol em (2014) | 10.3389/fmicb.2014.00176.
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