O Igaci foi fundado em 10 de fevereiro de 2001. No mesmo ano, em sua primeira participação em competições oficiais, conseguiu o vice-campeonato na Segunda Divisão alagoana. Após disputar novamente a Segunda Divisão em 2002, o Igaci afastou-se do futebol pelos três anos seguintes, só retornando em 2006, quando, sob a batuta do treinador Régis Silva, venceu o campeonato e foi promovido à Primeira Divisão estadual. O Igaci conquistou o título empatando nas finais com o Universal de Rio Largo em 1 x 1 e 0 x 0, vencendo a decisão por pênaltis por 4 a 1 no dia 18 de novembro, no Estádio Zequinha Barbosa. O atacante Valmir foi o responsável pelo título bater o pênalti decisivo.