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Em sua primeira participação num evento de qualificação para a Copa do Mundo, o Botsuana foi dirigido por Freddie Mwila, porém não conseguiu classificar-se, terminando em terceiro lugar no seu grupo, atrás de Costa do Marfim e Níger, apenas a frente do Sudão.
O Botsuana foi sorteado para jogar um jogo preliminar às eliminatórias, que foram feitos nos dias 8 de Abril e 22 de Abril de 2000, contra a Zâmbia. O Botsuana perdeu os dois jogos pelo placar de 1-0.[carece de fontes?]