Euryarchaeota
Euryarchaeota | |||||
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Euryarchaeota (do grego: εὐρύς eurús, "largo") é um reino do domínio Archaea que inclui um grupo muito diverso de formas termofílicas e halofílicas, aeróbicas e anaeróbicas.[3] As arqueias do agrupamento Euryarchaeota são altamente diversas e incluem as espécies metanogénicas (as arqueias metanogénicas), frequentemente encontrados nos intestinos de mamíferos, as espécies conhecidas por halobactérias, que sobrevivem em concentrações extremas de sal, e alguns organismos extremamente termofílicos, aeróbios e anaeróbios, que geralmente vivem em temperaturas entre 41 °C e 122 °C. Diferem dos outros arqueanos com base principalmente nas sequências rRNA e na sua DNA polimerase de estrutura única.[4]
Descrição
[editar | editar código-fonte]Os Euryarchaeota são diversos em aparência e propriedades metabólicas. O filo contém organismos com uma grande variedade de formas, incluindo bastonetes e cocos. Euryarchaeota pode aparecer gram-positivo ou gram-negativo dependendo se pseudomureína está presente na parede celular.[5] Os Euryarchaeota também demonstram estilos de vida diversos, incluindo organismos metanogénicos, halófilos, redutores de sulfato e termófilos extremos.[5] Outros vivem no oceano, suspensos na coluna de água com plâncton e bactérias. Embora esses Euryarchaeota marinhos sejam difíceis de cultivar e estudar em laboratório, o sequenciamento genómico sugere que eles são heterotróficos móveis.[6]
Embora se pensasse anteriormente que os euryarchaeota viviam apenas em ambientes extremos (em termos de temperatura, teor de sal e/ou pH), um artigo publicado em janeiro de 2019 mostrou que os Euryarchaeota também vivem em ambientes moderados, como baixa temperatura e ambientes ácidos. Em alguns casos, Euryarchaeota superou em número as bactérias presentes.[7]
Euryarchaeota também foram encontrados em outros ambientes moderados, como nascentes de água, pântanos, solo e rizosfera.[8] Alguns Euryarchaeota são altamente adaptáveis; os membros da ordem Halobacteriales são geralmente encontrados em ambientes extremamente salgados e ricos em enxofre, mas também podem crescer em concentrações de sal tão baixas quanto a da água do mar a 2,5%.[8]Nas rizosferas, a presença de Euryarchaeota parece ser dependente de micorrizas produzidas por fungos; uma maior população fúngica foi correlacionada com maior frequência e diversidade Euryarchaeota, enquanto a ausência de fungos micorrízicos foi correlacionada com a ausência de Euryarchaeota.[8]
Filogenia
[editar | editar código-fonte]A taxonomia atualmente mais consensual é baseada na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[9] and National Center for Biotechnology Information (NCBI):[10]
baseado em 16S rRNA em LTP_12_2021.[11][12][13] | Dombrowski et al., 2019,[14] Jordan et al., 2017[15] e Cavalier-Smith, 2020.[16] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Outras análises filogenéticas sugeriram que as Archaea do clado DPANN também podem pertencer a Euryarchaeota e que podem até ser um grupo polifilético ocupando diferentes posições filogenéticas dentro de Euryarchaeota. Também é debatido se o filo Altiarchaeota deve ser classificado em DPANN ou Euryarchaeota.[14] Um cladograma resumindo esta proposta é apresentado graficamente abaixo.[15][16] Os grupos marcados entre aspas são linhagens atribuídas ao DPANN, mas separadas filogeneticamente das demais.
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Por sua vez, a GTDB 08-RS214, com base em 53 marcadores proteícos, apresenta a seguinte árvore filogenética:[17][18][19]
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Sistemática
[editar | editar código-fonte]A nomenclatura atualmente mais consensual é baseada na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[24] e no National Center for Biotechnology Information (NCBI)[25], com base nas sequência do gene 16S rRNA.[26]
- Grupo Methanomada (NCBI)
- Methanobacteria Boone 2002
- Methanobacteriales Bach & Wolfe 1981
- Methanococci Boone 2002
- Methanobacteria Boone 2002
- Grupo Stenosarchaea (NCBI)
- Halobacteria Grant et al. 2002
- „Methanofastidiosa“ Nobu et al. 2016 (früher: ASA2/Arcl[27])
- „Methanomicrobia“ Garrity et al. 2003
- Methanocellales (anteriormente RC-I)[27]
- Methanomicrobiales
- Methanosarcinales
- Nanohaloarchaea
- outros
- Archaeoglobi Garrity & Holt 2002
- „Methanoliparia“ Borrel et al. 2019[28]
- „Methanonatronarchaeia“ Sorokin et al. 2017
- Methanopyri Garrity & Holt 2002
- Thermococci Zillig & Reysenbach 2002
- Outros géneros não atribuídos a nenhuma ordem ou família (em incertae sedis)[29]
- Não atribuído a nenhum grupo ou classe/atribuição incerta (em incertae sedis)
- „Thalassoarchaea“ Martin-Cuadrado et al. 2015 (NCBI: para Thermoplasmatota)
- Thermoplasmata Reysenbach 2002 (NCBI: para Thermoplasmatota)
- „Altiarchaeales“ Probst et al. 2014 (sin. Altiarchaea, antes: SM1;[27] NCBI: zu Altiarchaeota in DPANN)
- Agrupamentos não atribuídas no LPSN, mas listadas como Euryarchaeota na taxonomia do NCBI:
- „Theionarchaea“ Lazar et al. 2017[30] (parcialmente atribuído a Theinoarchaea; antes: Z7ME43[27])[31]
- „Hadesarchaea“ Baker et al. 2015 (sin. „Hadarchaeia“ Chuvochina et al.; antes SAGMEG: South-African Goldmine Miscellaneous Euryarchaeal Group).[27] O Genome Taxonomy Database (GTDB) representa a classe Hadesarcheia junto com a tribo Archaea B88_G9 (origem: bacia Guaymas, Golfo da CAlifórnia) num filo Hadarchaeota.[32][33][34]
- Candidate division MSBL1 (MSBL-1, Mediterranean Seafloor Brine Lake Group 1) van der Wielen et al. 2005 (syn. „Persephonarchaeia“ corrig. Mwirichia et al. 2016)[27][35] Die Vertreter der MSBL1 werden bislang (Stand 20. Februar 2023) in der GTDB nicht berücksichtigt, da die Genomdaten keine ausreichende Qualität haben.[36]
Adam et al. (2017) sehen die MSBL1-Archaeen zusammen mit den Hadesarchaea in einer gemeinsamen Klade mit vorgeschlagener Bezeichnung „Stygia“.[27][37]
Um número de grupos anteriormente atribuídos ao Euryarchaeota foram deslocados para o superfilo Archaea DPANN de acordo com descobertas mais recentes:
- Grupo Micrarchaeota-Diapherotrites, antes MEG-Cluster
- Aenigmarchaeota, antes DSEG-Cluster
- Grupo Woesearchaeota-Pacearchaeota, antes DHVEG-6-Cluster
Cladograma
[editar | editar código-fonte]Euryarchaeota |
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Notas:
♠ Taxon nur bei NCBI, nicht auf der LPSN.
Die Hadesarchaea werden alternativ als eigenständiges Phylum Hadesarchaeota geführt.[38][39]
Die Nanohaloarchaea werden alternativ als Nanohaloarchaeota der Archaeen-Supergruppe DPANN, einem Schwestertaxon der Euryarchaeota, zugeordnet.
Kladogramm der Euryarchaeota nach Spang et al. (2017)[30]
Euryarchaeota |
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Notas:
Predefinição:FNZ
● Klassifizierung mariner Archaeen
As arqueias marinhas podem ser classificadas da seguinte forma:[45][46][47][48][49]
- Marine Group I (MG-I oder MGI): marine Thaumarchaeota, Ordnung Nitrosopumilales[50] mit Untergruppen Ia (alias I.a) bis Id
- Marine Group II (MG-II): marine Euryarchaeota, Ordnung Poseidoniales (alias Poseidoniia/Thalassoarchaea)[51] mit Untergruppen IIa bis IId (IIa entspricht Poseidoniaceae, IIb entspricht Thalassarchaceae)
Viren, die MGII parasitieren, werden als Magroviren bezeichnet. - Marine Group III (MG-III): alias Marine Benthic Group D (MBG-D), ebenfalls marine Euryarchaeota[52]
- Marine Group IV (MG-IV): ebenfalls marine Euryarchaeota[53]
- Undinarchaeales (englisch marine MAGs) – MHVG (Marine Hydrothermal Vent Group): zu Undinarchaeota (DPANN)[54][55][56][57]
● Acrónimos de outros grupos:
- SAGMEG – South-African Gold Mine Miscellaneous Euryarchaeal Group
- MSBL – Mediterranean Sea Brine Lakes
- DHVE – deep-sea hydrothermal vent euryarchaeota
- MBGD – Marine Benthic Group D
- ANME – anaerobic methane oxidizing euryarchaeota
Referências
[editar | editar código-fonte]- ↑ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (Junho 1990). «Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. PMC 54159. PMID 2112744. doi:10.1073/pnas.87.12.4576
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- ↑ «LTP_12_2021 Release Notes» (PDF). Consultado em 23 fevereiro 2021
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- ↑ POr vezes referido por Theinoarchaea: Catherine Badel, Gaël Erauso, Annika L. Gomez, Ryan Catchpole, Mathieu Gonnet, Jacques Oberto, Patrick Forterre, Violette Da Cunha: The global distribution and evolutionary history of the pT26‐2 archaeal plasmid family. In: environmental microbiology. sfam 10 Sep 2019. doi:10.1111/1462-2920.14800
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- ↑ From the oilfield to the lab: How a special microbe turns oil into gases, Vom Ölfeld ins Labor: Wie eine besondere Mikrobe Erdöl in Gase zerlegt. Auf: EurekAlert! vom 22. Dezember 2021. Quelle: Max-Planck-Institut für Marine Mikrobiologie.
Scientists Have Cultivated a “Miracle Microbe” That Converts Oil Into Methane, auf SciTechDaily vom 23. Dezember 2021. Quelle: dito. - ↑ LPSN: Euryarchaeota, not assigned to order
- ↑ a b Anja Spang, Eva F. Caceres, Thijs J. G. Ettema: Genomic exploration of the diversity, ecology, and evolution of the archaeal domain of life, in: Science Band 357 Nr. 6351, eaaf3883, 11. August 2017, doi:10.1126/science.aaf3883
- ↑ Catherine Badel, Gaël Erauso, Annika L. Gomez, Ryan Catchpole, Mathieu Gonnet, Jacques Oberto, Patrick Forterre, Violette Da Cunha: The global distribution and evolutionary history of the pT26‐2 archaeal plasmid family (Memento vom 20. junho 2020 im Internet Archive), in: environmental microbiology, sfam, 10. September 2019, doi:10.1111/1462-2920.14800
- ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Thermococci archaeon isolate B88_G9
- ↑ GTDB: GCA_003660555.1: B88-G9 sp003660555
- ↑ GTDB: Hadarchaeota (phylum)
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: candidate division MSBL1.
- ↑ GTDB: Search: MSBL
- ↑ Aufgrund dieser Datenlage könnte „Stygia“ Adam et al. (2017) evtl. ein Synonym für Hadarchaeota nach GTDB sein.
- ↑ Yinzhao Wang, Gunter Wegener, Jialin Hou, Fengping Wang, Xiang Xiao. Expanding anaerobic alkane metabolism in the domain of Archaea, in: Nature Microbiologyvolume 4, S. 595–602, vom 4. März 2019, doi:10.1038/s41564-019-0364-2
- ↑ Fengping Wang: Behind the paper: Expanding anaerobic alkane metabolism in the domain of Archaea, in: Nature Microbiology (Contributor) vom 4. März 2019
- ↑ Romano Mwirichia, Intikhab Alam, Mamoon Rashid, Vinu Manikandan, Wail Ba alawi, Allan Kamau, David Ngugi, Markus Göker, Hans-Peter Klenk, Vladimir Bajic, Uli Stingl: Metabolic traits of an uncultured archaeal lineage -MSBL1- from brine pools of the Red Sea, in: Scientific Reports 6(19181), Januar 2016, doi:10.1038/srep19181
- ↑ Bjorn Carey: Wild Things: The Most Extreme Creatures, auf: LiveScience vom 7. Februar 2015
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- ↑ Previously undescribed lineage of Archaea illuminates microbial evolution:
- Royal Netherlands Institute for Sea Research (NIOZ), 10. August 2020
- phys.org, 10. August 2020
- ScienceDaily, 10. August 2020
- EurekAlert!, 10. August 2020
Bibliografia
[editar | editar código-fonte]- Cavalier-Smith T (Janeiro 2002). «The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 1): 7–76. PMID 11837318. doi:10.1099/00207713-52-1-7
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Ver também
[editar | editar código-fonte]Ligações externas
[editar | editar código-fonte]- Referências PubMed para Euryarchaeota
- Referências PubMed Central para Euryarchaeota
- Referências Google Scholar para Euryarchaeota