Tradicional clube da zona norte carioca, fundado abaixo de uma mangueira, o Colégio F. C, que mantém sede e estádio localizado em frente a estação do metrô de Colégio, cujo bairro é de mesmo nome, próximo a Irajá, despontou no antigo Departamento Autônomo, conseguindo alguns títulos importantes, tais quais, o da categoria Aspirantes, conquistado de maneira invicta, em 1966, da série Waldemar Machado Carneiro, além de ter se sagrado campeão da categoria principal, em 1976.
A profissionalização ocorreu em 1990 e a partir daquele ano, o Coleginho passou a disputar a Terceira Divisão do Rio de Janeiro.
Afastado das competições de âmbito profissional desde 1996, o Colégio se mantém em atividade, ao disputar alguns campeonatos promovidos pela Liga de Desportos de Nova Iguaçu, presidida por Luiz Carlos Pina. Sagrou-se vice-campeão de juniores do Campeonato Iguaçuano de 2009, quando perdeu a final para o Esporte Clube Brasileirinho, de Comendador Soares. Na Taça Cidade de Juniores de 2010, foi eliminado na semifinal pelo Bayer Esporte Clube, que se classificou à final contra o mesmo Brasileirinho, o seu algoz do ano anterior. Nas categorias infantil e juvenil, o time foi eliminado na primeira fase. Estreou em 1990, na terceira divisão de profissionais. No ano seguinte, com a criação do chamado Grupo “B” da Primeirona, foi convidado a integrar a segunda divisão juntamente com os times da antiga terceirona. Veio a disputar o profissionalismo até 1996, quando problemas de ordem financeira fizeram com que tivesse que se afastar.
