O Campeonato Brasiliense de Futebol de 2016 da Segunda Divisão, foi a 20ª edição da era profissional do Campeonato Brasiliense, da segunda divisão do estadual de futebol realizado no Distrito Federal e organizado pela Federação de Futebol do Distrito Federal. Foi disputado por 10 times, dos quais 2 foram promovidos à divisão principal, sendo o campeonato disputado em pontos corridos e em turno único.[1]
A competição foi disputada em duas fases. Na primeira, as equipes foram divididas em dois grupos, e os times se enfrentaram no formato de grupo contra grupo, em jogo único. Foram classificados para a segunda fase os dois melhores de cada chave, fazendo o cruzamento olímpico. A final da 20ª edição foi disputada em partida única em um campo neutro. Os finalistas garantiram vaga no Candangão 2017.
* Por causa da desigualdade na quantidade de jogos dos times dos grupo A e B, a classificação final dos times eliminados nas seminais e na primeira fase deu-se pelo aproveitamento.