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O ácido ribonucleico (ARN, em português: ácido ribonucleico; ou RNA, em inglês: ribonucleic acid) é um composto orgânico cujas moléculas contêm as instruções genéticas que controlam a codificação genética, a descodificação genética durante a tradução de proteínas, a sintetização das mesmas e a regulação e expressão dos genes. O ARN e o ADN são ácidos nucleicos e, juntamente com os lípidos, as proteínas e os glícidos, constituem as quatro maiores macromoléculas essenciais de todas as formas conhecidas de vida.

Do ponto de vista químico, o ARN é um longo polímero de unidades simples (monómeros) de nucleótidos, cuja cadeia principal é formada por moléculas de açúcares e fosfato intercalados unidos por ligações fosfodiéster. Ligada à molécula de açúcar está uma de quatro bases nitrogenadas. A sequência de bases ao longo da molécula de ARN constitui a informação genética. O ARN, ao contrário do ADN que forma uma dupla hélice bicatenária; é maioritariamente monocatenário, contudo, pode dobrar-se sobre si próprio. Os organismos celulares usam o ARN mensageiro (ARNm) para transportar a informação genética (usando as bases nitrogenadas guanina, uracilo, adenina e citosina; representadas pela letras G, U, A e C, respectivamente) que controla a síntese de proteínas específicas. Muitos vírus codificam a sua informação genética usando um genoma de ARN.

Algumas moléculas de ARN têm um papel activo nas células catalizando reacções biológicas, controlando a expressão dos genes ou sinalizando e transportando respostas a sinais celulares. Um destes processos activos é a síntese de proteínas, uma função universal na qual as moléculas de ARN controlam a sintetização de proteínas nos ribossomas. Este processo usa as moléculas do ARN transportador (ARNt) para levar aminoácidos para o ribossoma, onde o ARN ribossómico (ARNr) liga aminoácidos para formar proteínas.

A hairpin loop from a pre-mRNA. Highlighted are the nucleobases (green) and the ribose-phosphate backbone (blue). This is a single strand of RNA that folds back upon itself.

Comparação com o ADN[editar | editar código-fonte]

Bases numa molécula de ARN.
Three-dimensional representation of the 50S ribosomal subunit. Ribosomal RNA is in ochre, proteins in blue. The active site is a small segment of rRNA, indicated in red.

A estrutura química do ARN é muito semelhante à do ADN, mas difere em três aspectos principais:

  • Ao contrário da dupla hélice bicatenária do ADN, o ARN é uma molécula monocatenária[1] em muitas actividades biológicas suas e consiste duma cadeia mais curta de nucleótidos.[2] Porém, o ARN pode, por junção de pares de base complementares, formar hélices duplas, como por exemplo no ARNt.
  • Enquanto a "coluna vertebral" açúcar-fosfato do ADN contém desoxirribose, o ARN contém a ribose.[3] A ribose tem um hidroxilo aderido ao anel de pentose na posição 2', a desoxirribose não tem este hidroxilo. Os grupos hidroxilo na coluna da ribosa torna o ARN menos estável que o ADN porque isto aumenta a sua propensão à hidrólise.
  • A base complementar da adenina no ADN é a timina; no ARN, no entanto, é o uracilo, o qual é uma forma desmetilada da timina.[4]

Tal como o ADN, a maioria dos ARN biológicos activos, incluindo o ARNm, o ARNt, o ARNt, os ARNnp e outros ARNs não-codificantes, contêm sequências auto-complementares que permitem o dobramento de secções do ARN[5] e unir-se a si próprio para formar hélices duplas. As análises destes ARNs revela que estão altamente estruturados. Ao invés do ADN, as suas estruturas não consistem de longas hélices duplas, mas de colecções de pequenas hélices agrupadas em estruturas afins à proteínas. Da mesma maneira, os ARNs podem alcançar a catálise química (como as enzimas).[6] A determinação da estrutura dos ribossomas, um orgânulo de ARN proteicoque cataliza a formação de ligações de peptídios, revelou que o seu espaço activo está composto inteiramente por ARN.[7]

Estrutura[editar | editar código-fonte]

Ver artigo principal: Estrutura dos ácidos nucleicos
Watson-Crick base pairs in a siRNA (hydrogen atoms are not shown)

Cada nucleótido no ARN contém um açúcar de ribose, com carbonos de 1' até 5'. A base está aderida à posição 1', em geral, a adenina (A), a citosina (C), a guanina e o uracilo (U). A adenina e a guanina são purinas, a citocisina e o uracilo são pirimidinas. Um fosfato estã grudado na posição 3' duma ribose e o 5' na posição seguinte. Os fosfatos têm uma carga negativa, tornando o ARN uma molécula carregada (poli-anião). A bases forman pontes de hidrogéneo entre a citosina e a guanina, entre a adenina e o uracilo e entre a guanina e o uracilo.[8] Porém, outras interacções são possíveis, tais como um grupo de bases de adenina ligam-se en forma de bojo,[9] ou o tetraciclo GNRA que tem pares de base guanina–adenina.[8]

Um componente estrutural importante do ARN que o diferencia do ADN é a presença dum hidroxilo na posição 2' do açúcar ribose. A presença do hidroxilo faz com que a hélice adopta principalmente uma geometria A.[10] Contudo, em contexto duma só hélice com dous nucleótidos, o ARN pode, embora raramente, adoptar a forma B mais comummente observada no ADN.[11] A geometria A resulta num sulco profundo e estreito e noutro superficial e folgado.[12] Outra consequência da presença do hidroxilo na posição 2' é que em secções flexíveis duma molécula de ARN (isto é, não envolvidas na formação duma hélice dupla), pode atacar químicamente a ligação fosfodiéster adjacente para fender a coluna.[13]

Estrutura química do ARN.
Secondary structure of a telomerase RNA.

O ARN é transcrito somente com quatro bases nitrogenadas (a adenina, a citosina, a guanina e o uracilo).[14] Porém, esta bases e açúcares apensados podem ser modificados de várias maneiras acompanhando a maturação do ARN. A pseudouridina (Ψ), na qual a ligação entre o uracilo e a ribose deixa de ser uma ligação C-N para ser C-C e a ribotimidina (T) são achadas em vários lugares (os mais notáveis sendo o ciclo TΨC do ARNt).[15] Outra importante base modificada importante é a hipoxantina, uma forma desaminada da adenina cujos nucleosídeos são feitos de inosina (I). A inosina tem um papel chave no emparelhamento wobble do código genético.[16]

Há mais de cem nucleosídeos modificados que ocorrem naturalmente.[17] A maior diversidade de modificações é achada no ARNt,[18] embora a pseudouridina e os nucleosídeos com 2'-O-metilação presente no ARNr são os mais comuns.[19] O papel específico de muitas destas modificações no ARN não são totalmente percebidas. Porém, é importante destacar o facto de que, no ARN ribossómico, muitas das modificações post-transcripcionais ocorrem em regiões altamente funcionais, tais como o centro da peptidil transferase e na interface de subunidade; tudo isto indica que são importantes para o funcionamento normal organular e celular.[20]

A forma funcional das moléculas duma só hélice do ARN, tal como as proteínas, costuma depender também uma estrutura terciária específica. A armação necessária para a existência desta estrutura é fornecida por elementos da estrutura secundária, constituídos por ligações de hidrogéneo com a molécula. Esto leva à classifcação de vários "domínios" diferenciáveis da estrutura secundária como os hairpin loops, os bojos e os internal loops.[21] Dado que o ARN tem carga, os iões metálicos como o Mg2+ são precisos para estabilizar muitas estruturas secundárias e terciárias.[22]

O enantiómero de origen natural do ARN é o D-RNA composto por D-ribonucleótidos. Todos os centros quirais estão na D-ribose. Devido ao uso de L-ribose ou até L-ribonucleótides, o L-RNA pode ser sintetizado. O L-RNA é muito mais estável perante a degradação da ribonuclease (RNase).[23]

Tal como a estrutura de biopolímeros como as proteínas, é possível definir a topologia duma molécula dobrada de ARN. Isto costuma ser feito com contactos intra-cadeias dentro do ARN embrulhado; esta técnica é conhecida como topologia de circuito.

Síntese[editar | editar código-fonte]

Synthesis of RNA is usually catalyzed by an enzyme—RNA polymerase—using DNA as a template, a process known as transcription. Initiation of transcription begins with the binding of the enzyme to a promoter sequence in the DNA (usually found "upstream" of a gene). The DNA double helix is unwound by the helicase activity of the enzyme. The enzyme then progresses along the template strand in the 3’ to 5’ direction, synthesizing a complementary RNA molecule with elongation occurring in the 5’ to 3’ direction. The DNA sequence also dictates where termination of RNA synthesis will occur.[24]

Primary transcript RNAs are often modified by enzymes after transcription. For example, a poly(A) tail and a 5' cap are added to eukaryotic pre-mRNA and introns are removed by the spliceosome.

There are also a number of RNA-dependent RNA polymerases that use RNA as their template for synthesis of a new strand of RNA. For instance, a number of RNA viruses (such as poliovirus) use this type of enzyme to replicate their genetic material.[25] Also, RNA-dependent RNA polymerase is part of the RNA interference pathway in many organisms.[26]

Tipos de ARN[editar | editar código-fonte]

Visão geral[editar | editar código-fonte]

Structure of a hammerhead ribozyme, a ribozyme that cuts RNA

Messenger RNA (mRNA) is the RNA that carries information from DNA to the ribosome, the sites of protein synthesis (translation) in the cell. The coding sequence of the mRNA determines the amino acid sequence in the protein that is produced.[27] However, many RNAs do not code for protein (about 97% of the transcriptional output is non-protein-coding in eukaryotes[28][29][30][31]).

These so-called non-coding RNAs ("ncRNA") can be encoded by their own genes (RNA genes), but can also derive from mRNA introns.[32] The most prominent examples of non-coding RNAs are transfer RNA (tRNA) and ribosomal RNA (rRNA), both of which are involved in the process of translation.[4] There are also non-coding RNAs involved in gene regulation, RNA processing and other roles. Certain RNAs are able to catalyse chemical reactions such as cutting and ligating other RNA molecules,[33] and the catalysis of peptide bond formation in the ribosome;[7] these are known as ribozymes.

No comprimento[editar | editar código-fonte]

Dependendo do comprimento da cadeia de ARN, o ARN inclui o pequeno ARN e o ARN longo.[34] Geralmente, os pequenos ARNs são menores de duzentos nucleótidos em comprimento e os ARNs longos são maiores do que duzentos.[35] O ARN longo inclui, principalmente, o ARN longo não-codificante (IncRNA) e o ARNm. O pequeno ARN inclui, principalmente, o ARN ribossómico (ARNr) 5.8S, o ARNr 5S, o ARN transportador (ARNt), o microARN (miRNA), o siRNA, o SnoRNA, o piRNA, o tsRNA[36] e o srRNA).[37]

Na tradução[editar | editar código-fonte]

Messenger RNA (mRNA) carries information about a protein sequence to the ribosomes, the protein synthesis factories in the cell. It is coded so that every three nucleotides (a codon) corresponds to one amino acid. In eukaryotic cells, once precursor mRNA (pre-mRNA) has been transcribed from DNA, it is processed to mature mRNA. This removes its introns—non-coding sections of the pre-mRNA. The mRNA is then exported from the nucleus to the cytoplasm, where it is bound to ribosomes and translated into its corresponding protein form with the help of tRNA. In prokaryotic cells, which do not have nucleus and cytoplasm compartments, mRNA can bind to ribosomes while it is being transcribed from DNA. After a certain amount of time, the message degrades into its component nucleotides with the assistance of ribonucleases.[27]

Transfer RNA (tRNA) is a small RNA chain of about 80 nucleotides that transfers a specific amino acid to a growing polypeptide chain at the ribosomal site of protein synthesis during translation. It has sites for amino acid attachment and an anticodon region for codon recognition that binds to a specific sequence on the messenger RNA chain through hydrogen bonding.[32]

Ribosomal RNA (rRNA) is the catalytic component of the ribosomes. Eukaryotic ribosomes contain four different rRNA molecules: 18S, 5.8S, 28S and 5S rRNA. Three of the rRNA molecules are synthesized in the nucleolus, and one is synthesized elsewhere. In the cytoplasm, ribosomal RNA and protein combine to form a nucleoprotein called a ribosome. The ribosome binds mRNA and carries out protein synthesis. Several ribosomes may be attached to a single mRNA at any time.[27] Nearly all the RNA found in a typical eukaryotic cell is rRNA.

Transfer-messenger RNA (tmRNA) is found in many bacteria and plastids. It tags proteins encoded by mRNAs that lack stop codons for degradation and prevents the ribosome from stalling.[38]

ARNs interferentes[editar | editar código-fonte]

Several types of RNA can downregulate gene expression by being complementary to a part of an mRNA or a gene's DNA.[39][40] MicroRNAs (miRNA; 21-22 nt) are found in eukaryotes and act through RNA interference (RNAi), where an effector complex of miRNA and enzymes can cleave complementary mRNA, block the mRNA from being translated, or accelerate its degradation.[41][42]

While small interfering RNAs (siRNA; 20-25 nt) are often produced by breakdown of viral RNA, there are also endogenous sources of siRNAs.[43][44] siRNAs act through RNA interference in a fashion similar to miRNAs. Some miRNAs and siRNAs can cause genes they target to be methylated, thereby decreasing or increasing transcription of those genes.[45][46][47] Animals have Piwi-interacting RNAs (piRNA; 29-30 nt) that are active in germline cells and are thought to be a defense against transposons and play a role in gametogenesis.[48][49]

Many prokaryotes have CRISPR RNAs, a regulatory system similar to RNA interference.[50] Antisense RNAs are widespread; most downregulate a gene, but a few are activators of transcription.[51] One way antisense RNA can act is by binding to an mRNA, forming double-stranded RNA that is enzymatically degraded.[52] There are many long noncoding RNAs that regulate genes in eukaryotes,[53] one such RNA is Xist, which coats one X chromosome in female mammals and inactivates it.[54]

An mRNA may contain regulatory elements itself, such as riboswitches, in the 5' untranslated region or 3' untranslated region; these cis-regulatory elements regulate the activity of that mRNA.[55] The untranslated regions can also contain elements that regulate other genes.[56]

No processamento do ARN[editar | editar código-fonte]

Uridine to pseudouridine is a common RNA modification.

Many RNAs are involved in modifying other RNAs. Introns are spliced out of pre-mRNA by spliceosomes, which contain several small nuclear RNAs (snRNA),[4] or the introns can be ribozymes that are spliced by themselves.[57] RNA can also be altered by having its nucleotides modified to nucleotides other than A, C, G and U. In eukaryotes, modifications of RNA nucleotides are in general directed by small nucleolar RNAs (snoRNA; 60–300 nt),[32] found in the nucleolus and cajal bodies. snoRNAs associate with enzymes and guide them to a spot on an RNA by basepairing to that RNA. These enzymes then perform the nucleotide modification. rRNAs and tRNAs are extensively modified, but snRNAs and mRNAs can also be the target of base modification.[58][59] RNA can also be methylated.[60][61]

Genoma de ARN[editar | editar código-fonte]

Like DNA, RNA can carry genetic information. RNA viruses have genomes composed of RNA that encodes a number of proteins. The viral genome is replicated by some of those proteins, while other proteins protect the genome as the virus particle moves to a new host cell. Viroids are another group of pathogens, but they consist only of RNA, do not encode any protein and are replicated by a host plant cell's polymerase.[62]

Na transcrição reversa[editar | editar código-fonte]

Reverse transcribing viruses replicate their genomes by reverse transcribing DNA copies from their RNA; these DNA copies are then transcribed to new RNA. Retrotransposons also spread by copying DNA and RNA from one another,[63] and telomerase contains an RNA that is used as template for building the ends of eukaryotic chromosomes.[64]

ARN de duas hélices[editar | editar código-fonte]

Double-stranded RNA (dsRNA) is RNA with two complementary strands, similar to the DNA found in all cells. dsRNA forms the genetic material of some viruses (double-stranded RNA viruses). Double-stranded RNA such as viral RNA or siRNA can trigger RNA interference in eukaryotes, as well as interferon response in vertebrates.[65][66][67][68]

ARN circular[editar | editar código-fonte]

In the late 1970s, it was shown that there is a single stranded covalently closed, i.e. circular form of RNA expressed throughout the animal and plant kingdom (see circRNA).[69] circRNAs are thought to arise via a "back-splice" reaction where the spliceosome joins a downstream donor to an upstream acceptor splice site. So far the function of circRNAs is largely unknown, although for few examples a microRNA sponging activity has been demonstrated.

Descobrimentos chave na biologia do ARN[editar | editar código-fonte]

Robert W. Holley, à esquerda, posa com a sua equipa de investigação.

A pesquisa no ARN tem levado a descobertas muito importantes no campo da biologia e numerosos laureados Nobel. Os ácidos nucleicos foram descobertos em 1868 por Friederich Miescher quem os chamou nucleína dado que era achada no núcleo.[70] Posteriormente foi descoberto que as células procariontes, que não têm núcleo, também contêm ácidos nucleicos. O papel do ARN na síntese de proteínas já era conjeturada em 1939.[71] Severo Ochoa recebeu o Prémio Nobel de Fisiologia ou Medicina de 1959 (partilhado com Arthur Kornberg) após ter descoberto uma enzima que era capaz de sintetizar o ARN no laboratório.[72] Porém, a enzima descoberta por Ochoa (polinucleótido fosforilase) não estara implicada na síntese do ARN, mas na sua degradação. Em 1956 Alex Rich e David Davies hibridizaram duas cadeias de ARN para formar o primeiro cristal de ARN cuja estrutura podia ser determinada por uma cristalografia de raios X.[73]

A sequência do ARNt de setenta e sete nucleóditos duma levedura foi achada por Robert W. Holley em 1965,[74] achado pelo qual foi galardoado com o Prémio Nobel de Fisiologia ou Medicina de 1968 (partilhado com Har Gobind Khorana e Marshall Nirenberg).[75]

No começo da década de 1970, os retrovírus e a transcriptase reversa foram descobertos, mostrando por primeira vez que as enzimas eram capazes de tornar o ARN em ADN (o oposto do ciclo consuetudinário da transmissão da informação genética). Por este trabalho, David Baltimore, Renato Dulbecco e Howard M.Temin foram laureados com o Prémio Nobel de Fisiologia ou Medicina em 1975.[76] Em 1976, Walter Fiers e a sua equipa determinaram a primeira sequência completa de nucleótidos do genoma dum vírus ARN, o do bacteriófago MS2.[77]

Em 1977, os intrões e o splicing do ARN foram achados tanto no vírus dos mamíferos e nos genes celulares, resultando na outorgação do Prémio Nobel de Fisiologia ou Medicina de 1993 para Philip Sharp e Richard Roberts.[78] As moléculas catalíticas do ARN (os ribossomas) foram descobertas no começo da década de 1980, levando à laureação do Prémio Nobel de Química de 1989 para Thomas Cech e Sidney Altman.[79] Em 1990, achou-se nas Petunia que genes introduzidos podem silenciar genes próprios análogos da planta, agora sabe-se que é devido ao ARN interferente.[80][81]

Por volta da mesma altura, vinte e dous nucleótidos de ARN, agora chamados micro-ARN, foram relacionados com o desenvolvimento da Caenorhabditis elegans.[82] Os estudos no ARN inferente levaram à concessão do Prémio Nobel de Fisiologia ou Medicina de 2006 para Andrew Fire and Craig Mello,[83] e a concessão do Prémio Nobel de Química desse mesmo ano para Roger Kornberg.[84] A descoberta do ARN regulador de genes, tem iniciado a investigação de possíveis fármacos feitos de ARN, tais como o siRNA, para silenciar os genes.[85]

Importância para a química pré-biótica e para a abiogénese[editar | editar código-fonte]

Em 1967, Carl Woese teorizou que o ARN pode ser catalítico e sugeriu que as primeiras formas de vida (moléculas autorreplicantes) podem ter usado o ARN tanto para transportar a transmitir a informação genética como para catalizar reacções bioquímicas, constituindo a hipótese do mundo de ARN.[86][87]

Em Março de 2015, vários nucleótidos complexos de ADN e ARN, incluindo a citosina, o uracilo e a timina, foram alegadamente formados em laboratório sob condições típicas do espaço sideral, usando precursores químicos, tais como a pirimidina, um composto orgânico comummente achado em meteoritos. A pirimidina, tal como os hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HAPs), é um dos compostos ricos em carbono mais abundantes no Universo e podem ter-se formado em gigantes vermelhas ou nas nuvens interestelares.[88]

Ver também[editar | editar código-fonte]

Referências[editar | editar código-fonte]

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