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Coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2: diferenças entre revisões

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O '''coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2''' ('''SARS-CoV-2''') (em [[Língua inglesa|Inglês]]: '''S'''evere '''a'''cute '''r'''espiratory '''s'''yndrome '''co'''rona'''v'''irus '''2'''),<ref name="CoronavirusStudyGroup" /><ref name=":2">{{citar jornal|url=https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51466362 |título=Coronavirus disease named Covid-19 |data=11 de fevereiro de 2020 |obra=[[BBC News Online]] |arquivourl=https://web.archive.org/web/20200215204154/https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51466362 |arquivodata=15 de fevereiro de 2020 |urlmorta= não|acessodata=15 de fevereiro de 2020 }}</ref> inicialmente denominado provisoriamente de "'''2019-nCoV'''" (em [[Língua inglesa|Inglês]]: '''2019 n'''ovel '''co'''rona'''v'''irus),<ref name="WHO21Jan2020">{{citar relatório|vauthors=((World Health Organization))|ano=2020|título=Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV): interim guidance v1, January 2020|autorlink=World Health Organization|publicado=World Health Organization|hdl=10665/330376|id=WHO/2019-nCoV/Surveillance/v2020.1}}</ref><ref>{{citar web|título=Healthcare Professionals: Frequently Asked Questions and Answers|website=United States [[Centers for Disease Control and Prevention]] (CDC)|data=11 de fevereiro de 2020|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/faq.html|acessodata=15 de fevereiro de 2020|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200214023335/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/faq.html|arquivodata=14 de fevereiro de 2020|urlmorta=unfit}}</ref><ref>{{citar web|título=About Novel Coronavirus (2019-nCoV)|website=United States [[Centers for Disease Control and Prevention]] (CDC)|data=11 de fevereiro de 2020|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/index.html|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200211105920/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/index.html|arquivodata=11 de fevereiro de 2020|urlmorta=unfit|acessodata=25 de fevereiro de 2020}}</ref> por vezes denominado "coronavírus de Wuhan",<ref name="HuangNPR" /> ou "vírus da COVID-19",<ref name="COVIDname" /> é um [[Vírus (+)ssRNA|vírus ARN de cadeia simples positiva]] ([[genoma]] linear).<ref name=":xinhuanet9Jan2020">{{citar jornal|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm |título=New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert |acessodata=9 de janeiro de 2020 |urlmorta= não|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200109084208/http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm |arquivodata=9 de janeiro de 2020 |agência=[[Xinhua]] }}</ref><ref name=":gisaid">{{citar web|url=https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020 |título=CoV2020 |website=GISAID EpifluDB |urlmorta= não|acessodata=12 de janeiro de 2020 |url-access=registro|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200112130540/https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020 |arquivodata=12 de janeiro de 2020}}</ref> É contagioso entre seres humanos e é a causa da doença [[COVID-19]], da qual existe uma [[Pandemia de COVID-19|pandemia em curso]].<ref name="NYT 20200130" /><ref name="Chan24Jan2020" />
O '''coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2''' ('''SARS-CoV-2''') (em [[Língua inglesa|Inglês]]: '''S'''evere '''a'''cute '''r'''espiratory '''s'''yndrome '''co'''rona'''v'''irus '''2'''),<ref name="CoronavirusStudyGroup" /><ref name=":2">{{citar jornal|url=https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51466362 |título=Coronavirus disease named Covid-19 |data=11 de fevereiro de 2020 |obra=[[BBC News Online]] |arquivourl=https://web.archive.org/web/20200215204154/https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51466362 |arquivodata=15 de fevereiro de 2020 |urlmorta= não|acessodata=15 de fevereiro de 2020 }}</ref> inicialmente denominado provisoriamente de "'''2019-nCoV'''" (em [[Língua inglesa|Inglês]]: '''2019 n'''ovel '''co'''rona'''v'''irus),<ref name="WHO21Jan2020">{{citar relatório|vauthors=((World Health Organization))|ano=2020|título=Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV): interim guidance v1, January 2020|autorlink=World Health Organization|publicado=World Health Organization|hdl=10665/330376|id=WHO/2019-nCoV/Surveillance/v2020.1}}</ref><ref>{{citar web|título=Healthcare Professionals: Frequently Asked Questions and Answers|website=United States [[Centers for Disease Control and Prevention]] (CDC)|data=11 de fevereiro de 2020|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/faq.html|acessodata=15 de fevereiro de 2020|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200214023335/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/hcp/faq.html|arquivodata=14 de fevereiro de 2020|urlmorta=unfit}}</ref><ref>{{citar web|título=About Novel Coronavirus (2019-nCoV)|website=United States [[Centers for Disease Control and Prevention]] (CDC)|data=11 de fevereiro de 2020|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/index.html|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200211105920/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/index.html|arquivodata=11 de fevereiro de 2020|urlmorta=unfit|acessodata=25 de fevereiro de 2020}}</ref> por vezes denominado "coronavírus de Wuhan",<ref name="HuangNPR">{{citar web |url=https://www.npr.org/sections/goatsandsoda/2020/01/22/798277557/how-does-wuhan-coronavirus-compare-to-mers-sars-and-the-common-cold |título=How Does Wuhan Coronavirus Compare with MERS, SARS and the Common Cold? |data=22 de janeiro de 2020 |acessodata=3 de fevereiro de 2020 |website=[[NPR]] |arquivourl=https://web.archive.org/web/20200202094021/https://www.npr.org/sections/goatsandsoda/2020/01/22/798277557/how-does-wuhan-coronavirus-compare-to-mers-sars-and-the-common-cold |arquivodata=2 de fevereiro de 2020 |urlmorta=não |vauthors=Huang P}}</ref> ou "vírus da COVID-19",<ref name="COVIDname">{{citar web |url=https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it |título=Naming the coronavirus disease (COVID-2019) and the virus that causes it |acessodata=24 de fevereiro de 2020 |publicado=World Health Organization |citação=From a risk communications perspective, using the name SARS can have unintended consequences in terms of creating unnecessary fear for some populations.... For that reason and others, WHO has begun referring to the virus as "the virus responsible for COVID-19" or "the COVID-19 virus" when communicating with the public. Neither of these designations are [sic] intended as replacements for the official name of the virus as agreed by the ICTV.}}</ref> é um [[Vírus (+)ssRNA|vírus ARN de cadeia simples positiva]] ([[genoma]] linear).<ref name=":xinhuanet9Jan2020">{{citar jornal|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm |título=New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert |acessodata=9 de janeiro de 2020 |urlmorta= não|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200109084208/http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm |arquivodata=9 de janeiro de 2020 |agência=[[Xinhua]] }}</ref><ref name=":gisaid">{{citar web|url=https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020 |título=CoV2020 |website=GISAID EpifluDB |urlmorta= não|acessodata=12 de janeiro de 2020 |url-access=registro|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200112130540/https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020 |arquivodata=12 de janeiro de 2020}}</ref> É contagioso entre seres humanos e é a causa da doença [[COVID-19]], da qual existe uma [[Pandemia de COVID-19|pandemia em curso]].<ref name="NYT 20200130" /><ref name="Chan24Jan2020" />


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Devido a descoberta ter sido em [[Wuhan]], é por vezes denominada "vírus de Wuhan" ou "coronavírus de Wuhan",<ref name="HuangNPR" /><ref name="Fox2020">{{citar periódico |título=What you need to know about the Wuhan coronavirus |data=24 de janeiro de 2020 |periódico=[[Nature (journal)|Nature]] |doi=10.1038/d41586-020-00209-y |issn=0028-0836 |vauthors=Fox D}}</ref><ref>{{citar jornal |url=https://www.nbcnews.com/news/asian-america/cdc-chief-spurns-term-chinese-coronavirus-used-gop-lawmakers-n1156656 |título=GOP lawmakers continue to use 'Wuhan virus' or 'Chinese coronavirus' |data=12 de março de 2020 |acessodata=19 de março de 2020 |publicado=[[NBC News]] |urlmorta=não |vauthors=Yam K}}</ref><ref>{{citar jornal |url=https://www.foxnews.com/politics/kevin-mccarthy-pelosi-omar-chinese-coronavirus-racist |título=McCarthy knocks Dems after they claim saying 'Chinese coronavirus' is racist |data=11 de março de 2020 |acessodata=12 de março de 2020 |publicado=[[Fox News]] |urlmorta=não |vauthors=Dorman S}}</ref> embora a Organização Mundial de Saúde (OMS) desaconselhe a utilização de nomes baseados na localização.<ref>{{citar relatório |autorlink=World Health Organization |título=World Health Organization best practices for the naming of new human infectious diseases |publicado=World Health Organization |ano=2015 |id=WHO/HSE/FOS/15.1 |vauthors=((World Health Organization)) |hdl=10665/163636}}</ref> Para evitar confusão com a doença [[síndrome respiratória aguda grave]] (SARS), em comunicados públicos a OMS por vezes refere-se ao vírus como "vírus responsável pela COVID-19" ou "vírus da COVID-19".<ref name="COVIDname" /> Tanto o vírus como a doença são muitas vezes denominados "coronavírus" ou "[[novo coronavírus]]" pelo público em geral, embora cientistas usem termos mais precisos.<ref name="NYT6">{{citar jornal |url=https://www.nytimes.com/2020/03/04/us/coronavirus-recovery.html |título=We Spoke to Six Americans with Coronavirus |data=4 de março de 2020 |acessodata=16 de março de 2020 |website=[[The New York Times]] |vauthors=Harmon A}}</ref>
A [[Organização Mundial de Saúde]] (OMS) considera que morcegos são o [[reservatório natural]] mais provável do vírus,<ref name=":3" /> embora algumas diferenças entre os vírus encontrados em morcegos e os encontrados em seres humanos sugiram que os humanos foram infectados através de um hospedeiro intermédio.<ref name="nature feb2020" /> As primeiras infeções conhecidas foram descobertas na cidade de [[Wuhan]] ([[província]] de [[Hubei]], [[China]]) em dezembro de 2019.<ref name="NatureZhou" />


== História ==
== História ==
=== Hipóteses sobre a origem ===
=== Hipóteses sobre a origem ===
Apesar da estirpe ter sido descoberta em Wuhan,<ref name="NatureZhou" /> ainda não é claro qual foi a fonte original de transmissão viral para os seres humanos, nem quando é que a estirpe se tornou [[Patógeno|patogénica]] (produzir [[Doença infecciosa|doenças infecciosas]] nos [[hospedeiro]]s).<ref name="early">{{citar periódico|data=janeiro de 2020|título=Wuhan seafood market may not be source of novel virus spreading globally|periódico=Science|doi=10.1126/science.abb0611|issn=0036-8075|vauthors=Cohen J}}</ref><ref>{{citar web|url=https://www.popsci.com/story/health/wuhan-coronavirus-china-wet-market-wild-animal/|título=We're still not sure where the Wuhan coronavirus really came from|vauthors=Eschner K|data=28 de janeiro de 2020|website=[[Popular Science]]|urlmorta=não|arquivourl=https://archive.today/NXjMq|arquivodata=29 de janeiro de 2020|acessodata=30 de janeiro de 2020}}</ref><ref>{{citar periódico|data=21 de fevereiro de 2020|título=Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data|url=http://www.chinaxiv.org/abs/202002.00033|doi=10.12074/202002.00033|vauthors=Yu WB, Tang GD, Zhang L, Corlett RT|doi-broken-date=2020-02-26}}</ref><ref name="Proximal" /> O vírus da COVID-19 apresenta [[Distância genética|proximidade genética]] com os [[coronavírus]] encontrados em morcegos, dos quais provavelmente [[Vírus transmitidos por morcegos|originou-se]].<ref name="NatureZhou">{{citar periódico| vauthors = Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, Si HR, Zhu Y, Li B, Huang CL, Chen HD, Chen J, Luo Y, Guo H, Jiang RD, Liu MQ, Chen Y, Shen XR, Wang X, Zheng XS, Zhao K, Chen QJ, Deng F, Liu LL, Yan B, Zhan FX, Wang YY, Xiao GF, Shi ZL | display-authors = 6 |título= A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin |periódico= Nature | volume = 579 |número= 7798 |páginas= 270–273 |data=fevereiro de 2020 | pmid = 32015507 | doi = 10.1038/s41586-020-2012-7 }}</ref><ref name="LancetNowcasting">{{citar periódico| vauthors = Perlman S |título= Another Decade, Another Coronavirus |periódico= [[The New England Journal of Medicine]] | volume = 382 |número= 8 |páginas= 760–762 |data=fevereiro de 2020 | pmid = 31978944 | doi = 10.1056/NEJMe2001126 }}</ref><ref name=":4" /> Uma sequência de ácido nucleico em morcegos da espécie [[Rhinolophus affinis|''Rhinolophus'' ''affinis'']] recolhida na província de [[província de Yunnan|Yunnan]], também na China, revelou uma semelhança de 96% em relação ao SARS-CoV-2.<ref name="NatureZhou" /><ref name=":5" /> Mas, pensa-se que antes de ser introduzido aos seres humanos tenha também estado envolvido um [[Reservatório natural|reservatório]] animal intermédio, como o [[pangolim]].<ref name=":0">{{citar relatório| vauthors=((World Health Organization)) |ano=2020 |título=Novel Coronavirus (2019-nCoV): situation report, 22 |publicado=[[World Health Organization]] | hdl=10665/330991 }}</ref><ref name=":1">{{citar jornal|url=https://www.dw.com/en/coronavirus-from-bats-to-pangolins-how-do-viruses-reach-us/a-52291570|título=Coronavirus: From bats to pangolins, how do viruses reach us?|vauthors=Shield C|data=7 de fevereiro de 2020|publicado=[[Deutsche Welle]]|acessodata=13 de março de 2020}}</ref> Do ponto de vista [[Taxonomia|taxonómico]], este vírus está [[Classificação dos vírus|classificado]] como [[estirpe]] da espécie de [[SARS-CoV|coronavírus relacionado com a síndrome respiratória aguda grave]] (SARS-CoV).<ref name="CoronavirusStudyGroup">{{citar periódico| vauthors = Gobalenya AE, Baker SC, Baric RS, de Groot RJ, Drosten C, Gulyaeva AA, Haagmans BL, Lauber C, Leontovich AM, Neuman BW, Penzar D, Perlman S, ((Poon LLM)), Samborskiy DV, Sidorov IA, Sola I, Ziebuhr J|display-authors=3 |título= The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2 |periódico= Nature Microbiology |páginas= 1–9 |data=março de 2020 | pmid = 32123347 | doi = 10.1038/s41564-020-0695-z | url = https://www.nature.com/articles/s41564-020-0695-z }}</ref>
Apesar da estirpe ter sido descoberta em Wuhan,<ref name="NatureZhou">{{citar periódico |título=A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin |data=fevereiro de 2020 |periódico=Nature |número=7798 |páginas=270–273 |doi=10.1038/s41586-020-2012-7 |pmid=32015507 |vauthors=Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, Si HR, Zhu Y, Li B, Huang CL, Chen HD, Chen J, Luo Y, Guo H, Jiang RD, Liu MQ, Chen Y, Shen XR, Wang X, Zheng XS, Zhao K, Chen QJ, Deng F, Liu LL, Yan B, Zhan FX, Wang YY, Xiao GF, Shi ZL |volume=579 |display-authors=6}}</ref> ainda não é claro qual foi a fonte original de transmissão viral para os seres humanos, nem quando é que a estirpe se tornou [[Patógeno|patogénica]] (produzir [[Doença infecciosa|doenças infecciosas]] nos [[hospedeiro]]s).<ref name="early">{{citar periódico|data=janeiro de 2020|título=Wuhan seafood market may not be source of novel virus spreading globally|periódico=Science|doi=10.1126/science.abb0611|issn=0036-8075|vauthors=Cohen J}}</ref><ref>{{citar web|url=https://www.popsci.com/story/health/wuhan-coronavirus-china-wet-market-wild-animal/|título=We're still not sure where the Wuhan coronavirus really came from|vauthors=Eschner K|data=28 de janeiro de 2020|website=[[Popular Science]]|urlmorta=não|arquivourl=https://archive.today/NXjMq|arquivodata=29 de janeiro de 2020|acessodata=30 de janeiro de 2020}}</ref><ref>{{citar periódico|data=21 de fevereiro de 2020|título=Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data|url=http://www.chinaxiv.org/abs/202002.00033|doi=10.12074/202002.00033|vauthors=Yu WB, Tang GD, Zhang L, Corlett RT|doi-broken-date=2020-02-26}}</ref><ref name="Proximal" /> Através de estudos de similaridade,
observou-se que o vírus da COVID-19 apresenta [[Distância genética|proximidade genética]] com os [[coronavírus]] encontrados em morcegos, dos quais provavelmente [[Vírus transmitidos por morcegos|originou-se]].<ref name=":4" /><ref name="NatureZhou" /> Uma sequência de ácido nucleico em morcegos da espécie [[Rhinolophus affinis|''Rhinolophus'' ''affinis'']] recolhida na província de [[Província de Yunnan|Yunnan]], , também na China, revelou uma semelhança de 96% em relação ao SARS-CoV-2.<ref name="NatureZhou" /><ref name=":5" /> Contudo, é provável que antes de infectar os seres humanos, o vírus tenha tido um [[Reservatório natural|reservatório]] animal intermédio, como o [[pangolim]].<ref name=":0">{{citar relatório| vauthors=((World Health Organization)) |ano=2020 |título=Novel Coronavirus (2019-nCoV): situation report, 22 |publicado=[[World Health Organization]] | hdl=10665/330991 }}</ref><ref name=":1">{{citar jornal|url=https://www.dw.com/en/coronavirus-from-bats-to-pangolins-how-do-viruses-reach-us/a-52291570|título=Coronavirus: From bats to pangolins, how do viruses reach us?|vauthors=Shield C|data=7 de fevereiro de 2020|publicado=[[Deutsche Welle]]|acessodata=13 de março de 2020}}</ref> Do ponto de vista [[Taxonomia|taxonómico]], este vírus está [[Classificação dos vírus|classificado]] como [[estirpe]] da espécie de [[SARS-CoV|coronavírus relacionado com a síndrome respiratória aguda grave]] (SARS-CoV).<ref name="CoronavirusStudyGroup">{{citar periódico| vauthors = Gobalenya AE, Baker SC, Baric RS, de Groot RJ, Drosten C, Gulyaeva AA, Haagmans BL, Lauber C, Leontovich AM, Neuman BW, Penzar D, Perlman S, ((Poon LLM)), Samborskiy DV, Sidorov IA, Sola I, Ziebuhr J|display-authors=3 |título= The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2 |periódico= Nature Microbiology |páginas= 1–9 |data=março de 2020 | pmid = 32123347 | doi = 10.1038/s41564-020-0695-z | url = https://www.nature.com/articles/s41564-020-0695-z }}</ref>


Em 7 de fevereiro de 2020, investigadores na cidade de [[Guangzhou]] (província de [[Cantão (província)|Guangdong]], China) descobriram uma amostra de pangolim com uma sequência de [[ácido nucleico]] 99% idêntica ao SARS-CoV-2,<ref name=":6" /> com a diferença apenas de um aminoácido.<ref name=":7" /> Embora a lei chinesa proteja esses mamíferos, ainda é comum seu comércio ilegal para uso na [[medicina tradicional chinesa]].<ref>{{citar jornal|jornal=The Telegraph|url=https://www.telegraph.co.uk/science/2016/03/15/pangolins-13-facts-about-the-worlds-most-hunted-animal/|último=Kelly|primeiro=Guy|data=1 de janeiro de 2015|título=Pangolins: 13 facts about the world's most hunted animal|acessodata=9 de março de 2020}}</ref> Também no estado do [[Texas]] ([[Estados Unidos]]), microbiólogos e geneticistas encontraram evidências de [[rearranjo]] em coronavírus, o que sugere o envolvimento de pangolins na origem do SARS-CoV-2.<ref name="WongRecombination" /> No entanto, os coronavírus em pangolins encontrados até hoje partilham apenas 92% do genoma com o SARS-CoV-2, o que é insuficiente para provar que os pangolins sejam o hospedeiro intermédio. Em comparação, o vírus SARS responsável pelo surto de 2002-2004 partilhava 99,8% do seu genoma com os coronavírus da [[civeta]].<ref name="nature feb2020" />
Em 7 de fevereiro de 2020, investigadores na cidade de [[Guangzhou]] (província de [[Cantão (província)|Guangdong]], China) descobriram uma amostra de pangolim com uma sequência de [[ácido nucleico]] 99% idêntica ao SARS-CoV-2,<ref name=":6" /> com a diferença apenas de um aminoácido.<ref name=":7" /> Embora a lei chinesa proteja esses mamíferos, ainda é comum seu comércio ilegal para uso na [[medicina tradicional chinesa]].<ref>{{citar jornal|jornal=The Telegraph|url=https://www.telegraph.co.uk/science/2016/03/15/pangolins-13-facts-about-the-worlds-most-hunted-animal/|último=Kelly|primeiro=Guy|data=1 de janeiro de 2015|título=Pangolins: 13 facts about the world's most hunted animal|acessodata=9 de março de 2020}}</ref> Também no estado do [[Texas]] ([[Estados Unidos]]), microbiólogos e geneticistas encontraram evidências de [[rearranjo]] em coronavírus, o que sugere o envolvimento de pangolins na origem do SARS-CoV-2.<ref name="WongRecombination" /> No entanto, os coronavírus em pangolins encontrados até hoje partilham apenas 92% do genoma com o SARS-CoV-2, o que é insuficiente para provar que os pangolins sejam o hospedeiro intermédio. Em comparação, o vírus SARS responsável pelo surto de 2002-2004 partilhava 99,8% do seu genoma com os coronavírus da [[civeta]].<ref name="nature feb2020" />


Com isso, após artigo publicado na Nature Medicine, concluiu-se que o SARS-CoV-2 manifestou-se através de uma evolução natural. Onde o vírus evoluiu para seu estado patogênico atual por meio da seleção natural de um hospedeiro não humano e, então, passou a infectar seres humanos. Para esses pesquisadores, caso alguém estivesse tentando criar um novo coronavírus como patógeno, ele teria sido construído a partir de uma estrutura (espinha dorsal) já conhecida por causar outras doenças. Porém, o novo coronavirus se distingue de microrganismos que já existem e assemelhando a vírus encontrados em pangolins conforme citado anteriormente. <ref name=":9">{{Citar web |url=http://bioemfoco.com.br/noticia/ace2-proteina-que-facilita-entrada-do-sars-cov-2-no-organismo/ |titulo=ACE2: Conheça a proteína presente em nosso organismo que facilita entrada do SARS-CoV-2 |data=2020-04-23 |acessodata=2021-05-14 |website=Bioemfoco |lingua=pt-BR}}</ref>
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Devido a descoberta ter sido em Wuhan,<ref name="NatureZhou" /> é por vezes denominada "vírus de Wuhan" ou "coronavírus de Wuhan",<ref name="HuangNPR">{{citar web|url=https://www.npr.org/sections/goatsandsoda/2020/01/22/798277557/how-does-wuhan-coronavirus-compare-to-mers-sars-and-the-common-cold|título=How Does Wuhan Coronavirus Compare with MERS, SARS and the Common Cold?|vauthors=Huang P|data=22 de janeiro de 2020|website=[[NPR]]|urlmorta= não|arquivourl=https://web.archive.org/web/20200202094021/https://www.npr.org/sections/goatsandsoda/2020/01/22/798277557/how-does-wuhan-coronavirus-compare-to-mers-sars-and-the-common-cold|arquivodata=2 de fevereiro de 2020|acessodata=3 de fevereiro de 2020}}</ref><ref name="Fox2020">{{citar periódico|vauthors=Fox D|data=24 de janeiro de 2020|título=What you need to know about the Wuhan coronavirus|periódico=[[Nature (journal)|Nature]]|doi=10.1038/d41586-020-00209-y|issn=0028-0836}}</ref><ref>{{citar jornal|url=https://www.nbcnews.com/news/asian-america/cdc-chief-spurns-term-chinese-coronavirus-used-gop-lawmakers-n1156656|título=GOP lawmakers continue to use 'Wuhan virus' or 'Chinese coronavirus'|vauthors=Yam K|publicado=[[NBC News]]|urlmorta= não|data=12 de março de 2020|acessodata=19 de março de 2020}}</ref><ref>{{citar jornal|url=https://www.foxnews.com/politics/kevin-mccarthy-pelosi-omar-chinese-coronavirus-racist|título=McCarthy knocks Dems after they claim saying 'Chinese coronavirus' is racist|vauthors=Dorman S|publicado=[[Fox News]]|urlmorta= não|acessodata=12 de março de 2020|data=11 de março de 2020}}</ref> embora a Organização Mundial de Saúde (OMS) desaconselhe a utilização de nomes baseados na localização.<ref>{{citar relatório| vauthors = ((World Health Organization)) |ano= 2015 |título= World Health Organization best practices for the naming of new human infectious diseases |autorlink = World Health Organization |publicado= World Health Organization | hdl = 10665/163636 | id = WHO/HSE/FOS/15.1 }}</ref> Para evitar confusão com a doença [[síndrome respiratória aguda grave]] (SARS), em comunicados públicos a OMS por vezes refere-se ao vírus como "vírus responsável pela COVID-19" ou "vírus da COVID-19".<ref name="COVIDname">{{citar web|url=https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/naming-the-coronavirus-disease-(covid-2019)-and-the-virus-that-causes-it|título=Naming the coronavirus disease (COVID-2019) and the virus that causes it|publicado=World Health Organization|acessodata=24 de fevereiro de 2020|citação=From a risk communications perspective, using the name SARS can have unintended consequences in terms of creating unnecessary fear for some populations.... For that reason and others, WHO has begun referring to the virus as "the virus responsible for COVID-19" or "the COVID-19 virus" when communicating with the public. Neither of these designations are [sic] intended as replacements for the official name of the virus as agreed by the ICTV.}}</ref> Tanto o vírus como a doença são muitas vezes denominados "coronavírus" ou "[[novo coronavírus]]"<ref>{{citar web|url=https://g1.globo.com/bemestar/coronavirus/noticia/2020/04/11/estudo-aponta-3-tipos-do-novo-coronavirus.ghtml|publicado=Globo|obra=G1|título=Estudo aponta 3 tipos do novo coronavírus}}</ref> pelo público em geral, embora cientistas usem termos mais precisos.<ref name="NYT6">{{citar jornal| website = [[The New York Times]] | url = https://www.nytimes.com/2020/03/04/us/coronavirus-recovery.html | vauthors = Harmon A |título= We Spoke to Six Americans with Coronavirus |data=4 de março de 2020 |acessodata=16 de março de 2020}}</ref>

== Evolução do SARS COV 2 ==
O grupo de vírus mais próximo dos coronavírus são os torovírus. Ambos os grupos possuem homologia na replicase ORF 1b e as duas proteínas viron de S e M. A SARS é determinada como uma separação precoce dos coronavírus do grupo 2 com base em um conjunto de domínios compartilhados com o grupo 2.<ref name=":9" /> O SARS-CoV-2 está mais relacionado aos coronavírus do grupo 2, mas não segrega em nenhum dos outros três grupos de coronavírus. Foi proposta uma teoria de que houve co-evolução entre morcegos e os coronavírus que os utilizam como hospedeiro e, ao longo da evolução, esses coronavírus ganharam a capacidade de infectar seres humanos.

Experimentos bioquímicos revelaram aspectos importantes desse novo vírus e comprovaram algumas diferenças em relação ao SARS-CoV. Uma expressiva divergência está relacionada a mutações significativas no sítio de ligação ao receptor da proteína spike que interage com os receptores de ACE 2, proteína transmembrana que regula a pressão arterial atuando no sistema renina-angiotensina presentes no organismo humano. Nessa comparação, as modificações na linhagem do SARS-CoV -2 apresentaram cinco sítios de ligação de alta afinidade da proteína spike para com a ACE 2, o que possibilita tamanha acessibilidade às células humanas.<ref name=":9" />

Além disso, é importante salientar uma outra peculiaridade que é exclusiva do SARS-CoV-2, o que demonstra um processo evolutivo, envolvendo uma protease chamada de furina. Ainda que a proteína Spike presente no vírus promova a ligação entre patógeno e membrana celular, o micro-organismo necessita de uma espécie “acionamento” para que ocorra, de fato, a entrada do material genético do vírus no organismo humano. A proteína Spike possui um local de clivagem conhecido como S1/S2 que não foram encontrados em nenhum animal relacionado com essa família de vírus. Nessa região, a proteína Spike vai sofrer uma clivagem (quebra da proteína em aminoácidos) através da ação da furina e tal processo é fundamental para a consolidação da infecção viral, sobretudo, nas células pulmonares levando ao aparecimento de sintomas respiratórios graves.<ref name=":9" />


== Virologia ==
== Virologia ==

Revisão das 14h24min de 19 de maio de 2021

 Nota: Este artigo é sobre o vírus. Para a doença, veja COVID-19. Para a pandemia atualmente em curso, veja Pandemia de COVID-19.
Como ler uma infocaixa de taxonomiaCoronavírus da Síndrome Respiratória Aguda Grave 2
Classificação científica
Grupo: Grupo IV ((+)ssRNA)
Sem classificação: Vírus
Ordem: Nidovirales
Família: Coronaviridae
Gênero: Betacoronavirus
Distribuição geográfica
  Provável origem (China continental)   Países com presença confirmada do vírus
  Provável origem (China continental)
  Países com presença confirmada do vírus

O coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2) (em Inglês: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2),[1][2] inicialmente denominado provisoriamente de "2019-nCoV" (em Inglês: 2019 novel coronavirus),[3][4][5] por vezes denominado "coronavírus de Wuhan",[6] ou "vírus da COVID-19",[7] é um vírus ARN de cadeia simples positiva (genoma linear).[8][9] É contagioso entre seres humanos e é a causa da doença COVID-19, da qual existe uma pandemia em curso.[10][11]

Devido a descoberta ter sido em Wuhan, é por vezes denominada "vírus de Wuhan" ou "coronavírus de Wuhan",[6][12][13][14] embora a Organização Mundial de Saúde (OMS) desaconselhe a utilização de nomes baseados na localização.[15] Para evitar confusão com a doença síndrome respiratória aguda grave (SARS), em comunicados públicos a OMS por vezes refere-se ao vírus como "vírus responsável pela COVID-19" ou "vírus da COVID-19".[7] Tanto o vírus como a doença são muitas vezes denominados "coronavírus" ou "novo coronavírus" pelo público em geral, embora cientistas usem termos mais precisos.[16]

História

Hipóteses sobre a origem

Apesar da estirpe ter sido descoberta em Wuhan,[17] ainda não é claro qual foi a fonte original de transmissão viral para os seres humanos, nem quando é que a estirpe se tornou patogénica (produzir doenças infecciosas nos hospedeiros).[18][19][20][21] Através de estudos de similaridade,

observou-se que o vírus da COVID-19 apresenta proximidade genética com os coronavírus encontrados em morcegos, dos quais provavelmente originou-se.[22][17] Uma sequência de ácido nucleico em morcegos da espécie Rhinolophus affinis recolhida na província de Yunnan, , também na China, revelou uma semelhança de 96% em relação ao SARS-CoV-2.[17][23] Contudo, é provável que antes de infectar os seres humanos, o vírus tenha tido um reservatório animal intermédio, como o pangolim.[24][25] Do ponto de vista taxonómico, este vírus está classificado como estirpe da espécie de coronavírus relacionado com a síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV).[1]

Em 7 de fevereiro de 2020, investigadores na cidade de Guangzhou (província de Guangdong, China) descobriram uma amostra de pangolim com uma sequência de ácido nucleico 99% idêntica ao SARS-CoV-2,[26] com a diferença apenas de um aminoácido.[27] Embora a lei chinesa proteja esses mamíferos, ainda é comum seu comércio ilegal para uso na medicina tradicional chinesa.[28] Também no estado do Texas (Estados Unidos), microbiólogos e geneticistas encontraram evidências de rearranjo em coronavírus, o que sugere o envolvimento de pangolins na origem do SARS-CoV-2.[29] No entanto, os coronavírus em pangolins encontrados até hoje partilham apenas 92% do genoma com o SARS-CoV-2, o que é insuficiente para provar que os pangolins sejam o hospedeiro intermédio. Em comparação, o vírus SARS responsável pelo surto de 2002-2004 partilhava 99,8% do seu genoma com os coronavírus da civeta.[30]

Com isso, após artigo publicado na Nature Medicine, concluiu-se que o SARS-CoV-2 manifestou-se através de uma evolução natural. Onde o vírus evoluiu para seu estado patogênico atual por meio da seleção natural de um hospedeiro não humano e, então, passou a infectar seres humanos. Para esses pesquisadores, caso alguém estivesse tentando criar um novo coronavírus como patógeno, ele teria sido construído a partir de uma estrutura (espinha dorsal) já conhecida por causar outras doenças. Porém, o novo coronavirus se distingue de microrganismos que já existem e assemelhando a vírus encontrados em pangolins conforme citado anteriormente. [31]

Evolução do SARS COV 2

O grupo de vírus mais próximo dos coronavírus são os torovírus. Ambos os grupos possuem homologia na replicase ORF 1b e as duas proteínas viron de S e M. A SARS é determinada como uma separação precoce dos coronavírus do grupo 2 com base em um conjunto de domínios compartilhados com o grupo 2.[31] O SARS-CoV-2 está mais relacionado aos coronavírus do grupo 2, mas não segrega em nenhum dos outros três grupos de coronavírus. Foi proposta uma teoria de que houve co-evolução entre morcegos e os coronavírus que os utilizam como hospedeiro e, ao longo da evolução, esses coronavírus ganharam a capacidade de infectar seres humanos.

Experimentos bioquímicos revelaram aspectos importantes desse novo vírus e comprovaram algumas diferenças em relação ao SARS-CoV. Uma expressiva divergência está relacionada a mutações significativas no sítio de ligação ao receptor da proteína spike que interage com os receptores de ACE 2, proteína transmembrana que regula a pressão arterial atuando no sistema renina-angiotensina presentes no organismo humano. Nessa comparação, as modificações na linhagem do SARS-CoV -2 apresentaram cinco sítios de ligação de alta afinidade da proteína spike para com a ACE 2, o que possibilita tamanha acessibilidade às células humanas.[31]

Além disso, é importante salientar uma outra peculiaridade que é exclusiva do SARS-CoV-2, o que demonstra um processo evolutivo, envolvendo uma protease chamada de furina. Ainda que a proteína Spike presente no vírus promova a ligação entre patógeno e membrana celular, o micro-organismo necessita de uma espécie “acionamento” para que ocorra, de fato, a entrada do material genético do vírus no organismo humano. A proteína Spike possui um local de clivagem conhecido como S1/S2 que não foram encontrados em nenhum animal relacionado com essa família de vírus. Nessa região, a proteína Spike vai sofrer uma clivagem (quebra da proteína em aminoácidos) através da ação da furina e tal processo é fundamental para a consolidação da infecção viral, sobretudo, nas células pulmonares levando ao aparecimento de sintomas respiratórios graves.[31]

Virologia

Infecção

A transmissão do SARS-CoV-2 entre seres humanos foi confirmada pela primeira vez durante a pandemia de coronavírus de 2019-20.[11] A principal forma de transmissão são gotículas produzidas no sistema respiratório e expulsas ao tossir ou espirrar até um raio de 1,8 m.[32][33] Outra possível causa de infeção é o contacto indireto através de superfícies contaminadas.[34] A investigação preliminar sugere que o vírus possa permanecer ativo em plástico e aço até três dias, embora não consiga sobreviver em cartão mais do que um dia ou em cobre mais do que quatro horas.[35] Foi também observado ARN viral em fezes de pacientes infetados.[36]

Ainda não é claro se o vírus é infecioso durante o período de incubação.[37] Em 1 de fevereiro de 2020 a OMS indicava que "a transmissão a partir de casos assintomáticos provavelmente não é uma das principais formas de transmissão".[38] Acredita-se que a maior parte das infeções em seres humanos seja o resultado de transmissão entre pessoas que manifestam sintomas de COVID-19. No entanto, um modelo epidemiológico do início do surto na China sugere que a transmissão pré-sintomática pode ser típica entre as infeções documentadas.[39]

Um estudo publicado em janeiro de 2021, indica que mais de metade dos contágios pelo novo coronavírus poderá ser provocado por transmissão assintomática. Apesar de não ser possível obter números exatos, é estimado que 59% dos contágios podem ser provocados quer por pessoas antes de desenvolverem sintomas (35%), quer por pessoas que, embora infetadas, nunca vêm a ter sintomas.[40]

Reservatório

Micrografias eletrónicas de SARS-CoV-2 (a amarelo) a emergir de células humanas (coloração digital)

A OMS considera serem os morcegos o mais provável reservatório natural de SARS-CoV-2,[41] embora algumas diferenças entre os coronavírus dos morcegos e o SARS-CoV-2 sugiram que os seres humanos foram infetados através de um hospedeiro intermédio.[30] Embora já se tenha determinado que a estirpe é de origem natural.[21] A investigação do reservatório natural da estirpe de vírus que causou a pandemia de SARS em 2002-2004 permitiu a descoberta de diversos coronavírus semelhantes à SARS em morcegos, a maior parte com origem no género Rhinolophus dos morcegos-de-ferradura, e duas sequências de ácido nucleico encontradas em amostras de Rhinolophus sinicus revelaram uma semelhança de 80% em relação ao SARS-CoV-2.[22][42][43] Outra sequência de Rhinolophus affinis recolhida em Yunnan revelou uma semelhança de 96%.[17][23]

Um estudo metagenómico publicado em 2019 concluiu que o SARS-CoV, a estirpe que causa a SARS, era o coronavírus com maior distribuição entre uma amostra de pangolins-malaio.[44] Em 7 de fevereiro de 2020, foi anunciado que investigadores de Guangzhou tinham descoberto uma amostra de pangolim com uma sequência de ácido nucleico 99% idêntica ao SARS-CoV-2,[26] com a diferença apenas de um aminoácido.[27]

Em paralelo, microbiólogos e geneticistas no Texas encontraram evidências de rearranjo em coronavírus, o que sugere o envolvimento de pangolins na origem do SARS-CoV-2.[29] No entanto, os coronavírus em pangolins encontrados até hoje partilham apenas 92% do genoma com o SARS-CoV-2, o que é insuficiente para provar que os pangolins sejam o hospedeiro intermédio. Em comparação, o vírus SARS responsável pelo surto de 2002-2004 partilhava 99,8% do seu genoma com os coronavírus da civeta.[30]

Filogenética e taxonomia

O SARS-CoV-2 pertence a uma grande família de vírus denominada coronavírus. É um vírus ARN de cadeia simples positiva (+ssRNA). Os coronavírus têm a capacidade de causar várias doenças em seres humanos, desde a simples constipação até doenças mais graves como a síndrome respiratória do Médio Oriente (MERS). O SARS-CoV-2 é o sétimo coronavírus conhecido a poder infetar seres humanos, sendo os restantes o 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV e o SARS-CoV original.[45]

Tal como a estirpe que causou o surto de SARS em 2003, o SARS-CoV-2 é um membro do sub-género Sarbecovirus (betacoronavírus linhagem B).[46][47][48] A sua sequência de ARN tem o comprimento de aproximadamente 30 000 nucleobases.[9] No entanto, o SARS-CoV-2 é o único dos coronavírus a incorporar um local de clivagem polibásico, uma característica que se sabe aumentar a patogenicidade e ritmo reprodutivo de outros vírus.[21][49][50]

A partir de um número suficiente de genomas sequenciados, é possível reconstruir a árvore filogenética do historial de mutações de uma família de vírus. Em 12 de janeiro de 2020 foram isolados em Wuhan cinco genomas de SARS-CoV-2.[9][51] Em 30 de janeiro de 2020 eram conhecidos 42 genomas.[52] Uma análise filogenética dessas amostras revelou estarem relacionados até sete mutações com um ancestral comum, o que significa que a primeira infeção em seres humanos ocorreu em novembro ou dezembro de 2019.[52] Em 13 de março de 2020 estavam já amostrados e disponíveis publicamente 410 genomas de SARS-CoV-2.[53]

Em 11 de fevereiro de 2020, o Comité Internacional de Taxonomia de Vírus anunciou que, de acordo com as regras vigentes que determinam as relações hierárquicas entre os coronavírus com base nas sequência conservadas dos ácidos nucleicos, as diferenças entre o SARS-CoV-2 e o SARS-CoV responsável pelo surto de SARS eram insuficientes para serem classificados como duas espécies virais diferentes. Desta forma, o SARS-CoV-2 foi classificado como estirpe dos coronavírus associados à síndrome respiratória aguda (SARS-CoV).[1]

Biologia estrutural

Ilustração de um virião de coronavírus

Cada virião de SARS-CoV-2 mede aproximadamente 50–200 nanómetros de diâmetro.[54] Tal como outros coronavírus, o SARS-CoV-2 tem quatro proteínas estruturais, conhecidas como proteínas S (spike), E (envelope), M (membrana) e N (nucleocapsídeo). A proteína N contém o genoma ARN e em conjunto as proteínas S, E e M criam o envelope viral.[55] A proteína S é a proteína que permite ao vírus ligar-se à membrana celular de uma célula hospedeira.[55]

As primeiras experiências de modelação de proteínas na proteína S do vírus sugeriram que o SARS-CoV-2 tinha suficiente afinidade com os receptores de Enzima conversora da angiotensina 2 (ACE2) nas células humanas para as usar como mecanismo de penetração celular.[56] Em 22 de janeiro de 2020, um grupo chinês e um grupo norte-americano, de forma independente, conseguiram demonstrar experimentalmente que a ACE2 podia ser o receptor do SARS-CoV-2.[17][57][58][59][60][61] Vários estudos têm demonstrado que o SARS-CoV-2 tem uma maior afinidade com a ACE2 humana do que a estirpe de SARS original.[62] O SARS-CoV-2 pode também usar a proteína basigina para penetrar nas células do hospedeiro.[63] Para a penetração do SARS-CoV-2 também é fundamental o priming inicial da proteína S através de TMPRSS2.[64] O SARS-CoV-2 produz pelo menos três fatores de virulência que promovem a libertação de novos viriões das células hospedeiras e inibem a resposta imunitária.[55]

Variantes

Ver artigos principais: B.1.1.7, B.1.351 e Linhagem P.1

Conforme o Centros de Controle e Prevenção de Doenças (CDC), dos Estados Unidos, não há um conceito consolidado na comunidade científica para definir ou distinguir "variante", "cepa" e "linhagem", sendo usados indistintamente também no contexto da pandemia de COVID-19.[65] Ainda assim, conforme o Instituto Butantan, do Brasil, a mutação predominante no mundo em abril de 2021 se chamava D614G.[66] Essa mutação é comum às linhagens B.1.1.28 e B.1.1.33.[66] Da primeira linhagem se originaram as variantes P.1 e P.2 (com detecção inicial associada à transmissão comunitária no Brasil), enquanto que a variante N.9 tem origem na segunda linhagem mencionada.[66] Há ainda as linhagens B.1.1.7, B.1.351 e B.1.318 associadas a detecções iniciais da transmissão comunitária no Reino Unido, na África do Sul e Suíça respectivamente.[66]

Devido à capacidade transmissão alta e adoecimento severo, B.1.1.7, B.1.351 e P.1 foram classificadas internacionalmente como variantes de preocupação, enquanto B.1.427 e B.1.429 (ambas com detecção inicial associada à transmissão comunitária nos Estados Unidos) eram variantes de interesse em meados de abril de 2021.[67][68]

Epidemiologia

Ver artigo principal: Pandemia de COVID-19
Micrografia por MET de viriões de SARS-CoV-2 (a vermelho) isolados de um paciente.

Com base na baixa variabilidade verificada entre as sequências genómicas conhecidas de SARS-CoV-2, pensa-se que a estirpe tenha sido detectada pelas autoridades apenas poucas semanas após ter emergido entre a população humana no fim de 2019.[18][69] O caso mais antigo de infeção humana de que se tem conhecimento data de 17 de novembro de 2019.[70] Posteriormente, o vírus espalhou-se para todas as províncias da China e mais de cem países em todos os continentes.[71] Em todos os continentes foram confirmadas transmissões entre seres humanos.[11][72][73][74][75][76] Em 30 de janeiro de 2020, a OMS declarou o SARS-CoV-2 uma Emergência de Saúde Pública de Âmbito Internacional,[10][77] e em 11 de março uma pandemia.[78][79]

À data de 12 de maio de 2024 a pandemia tinha resultado em 775 481 312[71] casos confirmados de infeção em todo o mundo, dos quais 7 049 376[71] tinham resultado em morte e [71] tinham recuperado. Embora a proporção de infeções que resulta em infeções confirmadas ou que evolui para doença diagnosticável permaneça incerta,[80] um modelo matemático estimou que o número de pessoas infetadas apenas em Wuhan em 25 de janeiro de 2020 tenha sido de 75 815, data em que as infeções confirmadas eram bastante inferiores.[81]

Estima-se que o número básico de reprodução () do SARS-CoV-2 seja de entre 1,4 e 3,9.[82][83] Isto significa que é esperado que cada infeção pelo vírus resulte em 1,4 a 3,9 novas infeções quando nenhum membro da comunidade é imune e não é tomada nenhuma medida preventiva.

Ver também

Referências

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