Por volta de 1600 chegaram povos fugitivos das senzalas e das minas de ouro entra território baiano e mineiro e viveram por muito templo até a chegada de caravanas de fazendeiros fugindo das secas que assolavam o território baiano. Caravana formada por negros e brancos pobres que se ajuntaram ao quilombo em 1654 quando foi fundado o primeiro Arraial "Flores" Sua população estimada em 2010 era de 12.048 habitantes. Em 1740 após a construção da Igreja Nossa Senhora do Rosário, iniciou-se também as primeiras festas da Tradição local como as Folias e caçada da rainha nos festejos de Nossa Senhora do Rosário, Domingos Alves Maciel foi considerado o fundador do município.[6] O nomenclatura Flores de Goiás de acordo com a afirmação de antigos moradores devido a existência uma espécie de cebolinhas do campo que logo nas primeiras chuvas de setembro para outubro todo campo da região quilombola fica florido. Mas foi estabelecida legalmente através da lei estadual nº 4926, de 14 novembro de 1963.[6]
↑«Representantes». União Brasil. Consultado em 29 de setembro de 2022
↑IBGE (10 out. 2002). «Área territorial oficial». Resolução da Presidência do IBGE de n° 5 (R.PR-5/02). Consultado em 5 de dezembro de 2010
↑«Censo Populacional 2010». Censo Populacional 2010. Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE). 29 de novembro de 2010. Consultado em 11 de dezembro de 2010